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新生小鼠心肌肌钙蛋白Ⅰ相互作用蛋白的鉴定与功能预测
  • ISSN号:0577-7402
  • 期刊名称:《解放军医学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R446.61[医药卫生—诊断学;医药卫生—临床医学]
  • 作者机构:重庆医科大学附属儿童医院心脏内科,儿童发育疾病研究教育部重点实验室,儿童发育重大疾病国家国际科技合作基地,儿科学重庆市重点实验室,重庆400014
  • 相关基金:国家自然科学基金面上项目(81670212)
中文摘要:

目的 采用高通量蛋白质组学筛选鉴定小鼠心肌原代细胞中可能与心肌肌钙蛋白I(c Tn I)存在相互作用的蛋白质并通过生物信息学软件预测其可能参与的生物过程及信号通路。方法 取C57新生小鼠的心脏制备心肌原代细胞,提取细胞全蛋白行免疫共沉淀实验筛选出c Tn I的相互作用蛋白,通过质谱分析技术对其进行鉴定;将鉴定所得蛋白质信息输入生物信息学软件分析其理化性质,预测其可能参与的生物过程及信号通路。结果 共鉴定出262种可能与c Tn I存在相互作用的蛋白质,预测其可能参与的生物进程14条,KEGG生物学通路33条(P〈0.05)。结论 在小鼠心肌细胞中,有262种蛋白可能与c Tn I存在相互作用,其中部分蛋白可能参与心肌细胞钙离子内流及PI3K-Akt信号通路的调节。

英文摘要:

Objective To isolate and identify the proteins that interact with cardiac troponin I (cTnI) in primary mouse cardiomyocytes, and to analyze their biological processes and signaling pathways by use of High throughput proteomics and bioinformatics techniques. Methods The hearts of C57 neonatal mice were used to prepare the primary cardiomyocytes. The cTnI binding proteins were extracted from the whole cell protein by co-immunoprecipitation, and the proteins were analyzed and identified by mass spectrometry. Furthermore, the physicochemical properties, biological processes and signaling pathways of cTnI interacting proteins were predicted by bioinformatics tools. Results A total of 262 proteins were identified by mass spectrometry, cTnI binding proteins were involved in 14 biological processes and 33 KEGG biological pathways (P〈0.05). Conclusion In mouse cardiomyocytes, 262 kinds of proteins may interact with cTnI, and participate in regulation of calcium ion influx and PI3K-Akt signaling pathways.

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期刊信息
  • 《解放军医学杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国人民解放军总后勤部卫生部
  • 主办单位:人民军医出版社
  • 主编:
  • 地址:北京市100036信箱188分箱
  • 邮编:100036
  • 邮箱:mjcpla@pmmp.com.cn
  • 电话:010-51927306
  • 国际标准刊号:ISSN:0577-7402
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1056/R
  • 邮发代号:2-74
  • 获奖情况:
  • 全军医学期刊质量评比优秀期刊奖,北京市全优期刊奖,中国科学引文数据库来源期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,荷兰医学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),瑞典开放获取期刊指南,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:30614