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海洋沉积物DNA提取前的简易脱腐方法研究
  • ISSN号:1002-0470
  • 期刊名称:《高技术通讯》
  • 时间:0
  • 分类:TQ171.12[化学工程—玻璃工业;化学工程—硅酸盐工业] Q781[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]近海海洋环境科学国家重点实验室厦门大学海洋与环境学院,福建361005, [2]集美大学水产生物技术研究所,福建361021, [3]厦门大学生命科学学院,福建361005
  • 相关基金:863计划(2002AA603013)、国家自然科学基金(30370276)、“长江学者和创新团队发展计划”和福建省科技重点项目(2004I023)资助.致谢研究中蒙艾春香、杨小茹、骆苑蓉、王晓颖、李可和蔡莹等支持与帮助,在此谨表谢忱.
中文摘要:

针对海洋沉积环境样品DNA提取中的腐殖酸去除难题,采取先脱除腐殖酸再提取DNA的策略,进行了海洋沉积物DNA提取前的简易脱腐方法研究.依据腐殖酸的理化性质, 遴选出由Tris-HCl、EDTA、Na4P2O7、NaCl、PVP、Triton X-100及脱脂奶粉组成脱腐缓冲液,有效地脱除了腐殖酸.之后采用温和的溶菌酶-蛋白酶K-SDS直接裂解法,获取了大片段(分子量21kb以上)可进行rpoB 基因PCR扩增的海洋沉积物DNA,为海洋沉积环境分子生态学研究与海洋生物活性物质开发奠定了基础.

英文摘要:

A strategy of removing humic acids (HAs) prior to DNA extraction was conducted to resolve the problem of removing HAs from marine sediments in DNA extraction. According to the physical and chemical properties of HAs, the HAs' removing buffer composing of Tris-HCl, EDTA, Na4P2O7, NaCl, PVP, Triton X-100 and skim milk was screened out, which washed HAs out from the marine sediment samples successfully. Then a mild lysozyme-proteinase K-SDS direct lysis method was applied and the large fragment DNA was recovered from the marine shrimp pond, seaport and mangrove sediments samples, the molecular mass of which is more than 21 kb. These DNA extractions contain the sediment DNA which could be PCR amplified for rpoB gene. These work laid a foundation for molecular ecology research and exploiting the bioactive substances from marine sediments.

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期刊信息
  • 《高技术通讯》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国科学科技部
  • 主办单位:中国科学技术信息研究所
  • 主编:赵志耘
  • 地址:北京市三里河路54号
  • 邮编:100045
  • 邮箱:hitech@istic.ac.cn
  • 电话:010-68514060 68598272
  • 国际标准刊号:ISSN:1002-0470
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2770/N
  • 邮发代号:82-516
  • 获奖情况:
  • 《中国科学引文数据》刊源,《中国科技论文统计与分析》刊源
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘
  • 被引量:12178