位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
水稻与白叶枯病菌互作的基因表达谱分析与差异性表达基因的识别
  • ISSN号:0578-1752
  • 期刊名称:《中国农业科学》
  • 时间:0
  • 分类:S435.111.4[农业科学—农业昆虫与害虫防治;农业科学—植物保护]
  • 作者机构:[1]中国农业科学院植物保护研究所/植物病虫害生物学国家重点实验室,北京100094
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30370922)和中国农业科学院"杰出人才计划"项目
中文摘要:

[目的]从基因组水平上阐明水稻在与白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv. oryzae,Xoo)感病互作条件下基因表达反应的特征.[方法]用cDNA-AFLP方法对Xoo接种处理不同时间的水稻细胞进行基因表达谱分析.[结果]在测定的大约4 000个水稻cDNA片段中,363个(9.1%)是差异性表达的,其中295个受Xoo诱导上调表达,68个被抑制下调表达.根据在不同互作时间点的表达特征,它们可分为7种表达类型.对31个差异片段的序列同源性进行分析,发现它们在己公布的水稻全基因组中完全相同的序列,但只有10个基因具有已知或推断的生物学功能,其余21个基因功能未知.用荧光实时定量PCR分析法证实了cDNA-AFLP基因表达结果.[结论]构建了水稻-Xoo感病组合在细胞水平上互作的基因表达谱,从基因组水平上识别了一批受Xoo诱导或抑制表达、与水稻感病反应相关的基因,这些新基因的发现为开展水稻感病功能基因组学的研究提供了材料.

英文摘要:

[ Objective ] The study was conducted to elucidate the gene expression response of rice to bacterial inoculation with Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo) at the genomic levels. [Method ] cDNA-amplified fragment length polymorphism (cDNA-AFLP) was employed to analyze the gene expression patterns of mock- and Xoo-inoculated rice suspension cultured cells. [ Result ] Three hundred and sixty-three (9.1%) from approximately 4 000 cDNA fragments analyzed were differentially regulated (295 up-regulated and 68 down-regulated) 0.5, 3, 24 h after co-cultivation with Xoo. Seven gene expression patterns of the differential fragments were identified. Ten of 31 sequenced fragments showed homology to genes with known or putative functions involved in metabolism, pathogen response and signaling. 21 others did not show any homology to sequences with known functions. cDNA-AFLP differential patterns for 5 selected genes were confirmed via real-time reverse transcription PCR analysis. [ Conclusion ] Gene expression profiling in response to Xoo and differentially expressed genes of rice were revealed and identified via cDNA-AFLP analysis. This work begins to reveal potential disease susceptibility-related genes of this staple crop with global importance.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《中国农业科学》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院 中国农学会
  • 主编:万建民
  • 地址:北京中关村南大街12号中国农业科学院图书馆楼4101-4103室
  • 邮编:100081
  • 邮箱:zgnykx@caas.cn
  • 电话:010-82109808 82106279
  • 国际标准刊号:ISSN:0578-1752
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1328/S
  • 邮发代号:2-138
  • 获奖情况:
  • 中国期刊方阵“双高”期刊,第三届中国出版政府奖提名奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:85620