湖北是农业大省,但不是农业强省,一定程度上在于农业科教的优势没有得到充分发挥。本文在对湖北农业科研机构科技资源配置结构分析的基础上,构建农业科研机构科技资源配置效率评价的指标体系,运用曼奎斯特指数方法测度2000-2012年湖北省农业科研机构科技资源配置效率,结果表明:农林牧渔业科研机构技术效率平均提高了1.6个百分点,说明科技资源配置效率呈现上升的趋势,但不同行业之间的差异比较明显;技术进步率的降低导致农林牧渔业科研机构全要素生产率平均下降了0.6个百分点;农林牧渔业科研机构的规模效率值大于1,逐渐达到适度的规模水平。政策建议:要合理定位政府与市场的角色,充分发挥市场在农业科技资源配置中的决定作用,同时注重政府作用的发挥。农业科技投入的强度、方向适度微调。进行农业科技资源的有效整合。