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应用基因芯片技术检测结核分枝杆菌耐药基因
  • ISSN号:1005-4529
  • 期刊名称:《中华医院感染学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R521[医药卫生—临床医学;医药卫生—内科学]
  • 作者机构:[1]第三军医大学第一附属医院检验科,重庆400038
  • 相关基金:国家自然科学基金(30970766;30571775)军队“十一五”课题(06G073)
中文摘要:

目的应用基因芯片快速检测结核分枝杆菌耐利福平rpoB基因突变和耐异烟肼katG、inhA基因突变,建立一种新的分子药敏试验方法。方法根据结核分枝杆菌rpoB、katG、inhA基因序列设计探针并制作DNA芯片,PCR掺入法荧光标记,结核分枝杆菌基因突变位点的目的片断与DNA芯片杂交,同时以传统药敏试验和DNA测序法为对照。结果70株结核分枝杆菌临床分离株中,20株药物敏感株芯片杂交结果与标准株完全相同;30株耐RIF临床分离株均检测到rpoB基因突变;50株异烟肼耐药株中有41株检测到katG基因突变,9株检测到inhA基因突变,与测序结果完全一致。结论用DNA芯片可快速、特异地检测出大多数结核分枝杆菌分离株的rpoB、katG、inhA基因突变,可用于临床耐药性的检测,指导临床用药。

英文摘要:

OBJECTIVE To explore the feasibility of detecting the mutations of rpoB gene in rifampicin (RIF)- resistant Mycobacteriurn tuberculosis strains and that of katG and inhA genes in isoniazid (INH)-resistant by gene chip, and to develop a new, rapid detection method for drug resistance. METHODS Using traditional drug susceptibility testing and PCR-DNA sequencing as control, the rpoB, katG, and inhA genes from 70 M. tuberculosis clinical isolates were analyzed by PCR-oligonucleotide microchip. RESULTS Thirty of the RIF-resistant M. tuberculosis strains were detected for the mutations of rpoB gene by gene chip. Among 50 INH-resistant M. tuberculosis strains, 40 strains were detected for the mutations of katG gene and 10 strains were detected out the mutations of inhA gene. Twenty of the drug-sensitive strains were identical with the type strain, which were consistent with the results of DNA sequencing. CONCLUSIONS Using the gene chip can detect gene mutation of drug resistantce with higher specificity and sensitivity, which can be used for clinical detection of drug-resistant strains in clinics.

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期刊信息
  • 《中华医院感染学杂志》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国人民解放军总医院
  • 主办单位:中华预防医学会
  • 主编:
  • 地址:北京复兴路28号
  • 邮编:100039
  • 邮箱:zhyygrxzz@21cn.com
  • 电话:010-66939464
  • 国际标准刊号:ISSN:1005-4529
  • 国内统一刊号:ISSN:11-3456/R
  • 邮发代号:82-747
  • 获奖情况:
  • 中华预防医学会期刊评比优秀奖,中华预防医学会期刊评比编辑奖,中华预防医学会期刊评比学术奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:111886