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分子动力学中平行六面体的邻位算法

ISSN号：0023-074X
期刊名称：《科学通报》
时间：0
分类：O174.14[理学—数学;理学—基础数学] TG111.4[金属学及工艺—物理冶金;金属学及工艺—金属学]
作者机构：[1]哈尔滨工业大学航天科学与力学系,哈尔滨150001, [2]G.W. Woodruff School of Mechanical Engineering, Georgia Institute of Technology, Atlanta 30332-0405, USA
相关基金：国家自然科学基金（批准号：10472028）、高等学校博士学科点专项科研基金和黑龙江省杰出青年基金资助项目;致谢感谢甄玉宝博士对本文提出了很多宝贵的意见!

中文摘要：

在分子动力学模拟中,Verlet列表法、元胞链接列表法和其他一些改进的算法已经被用来提高计算效率.然而,这些方法大部分应用在立方体系.本文扩展了原始算法的应用领域,使其适用于NP系综,并可以在外载荷作用下进行系统仿真.此外,对于Metric-tensor的压强算法提出相应的标度矩阵,使得邻位算法可以应用在新的压强算法上.同时,还针对平行六面体盒子提出了一种联合算法.该方法综合了改进的Verlet列表法和元胞列表法的优点,可以快速确定平行六面体盒子中每个原子的邻位原子,从而提高仿真速度.最后,利用Lennard-Jones势函数的分子动力学模拟实验验证了本算法的有效性和正确性.

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