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小果野蕉(Musa acuminata)全基因组NBS抗病基因的鉴定与分析
  • ISSN号:1005-3395
  • 期刊名称:《热带亚热带植物学报》
  • 时间:0
  • 分类:S511[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]中国科学院华南植物园,中国科学院植物资源保护与可持续利用重点实验室,广州510650, [2]中国科学院大学,北京100049, [3]中国热带农业科学院南亚热带作物研究所,广东湛江524091
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31261140366,31101535);中国科学院植物资源保护与可持续利用实验室青年基金项目(Y2013720108014)资助
中文摘要:

为探讨小果野蕉(Musa acuminata)中NBS 基因的功能,基于新近发表的小果野蕉全基因组序列,对NBS 基因家族进行鉴定、分类和染色体定位,解析基因的复制特征、系统发育关系及上游启动子调控元件类别,推测这些基因在小果野蕉中可能的功能.结果表明,在小果野蕉全基因组中鉴定出125 个NBS 基因,包括78 个标准和47 个非标准NBS 基因.多数NBS 基因在染色体上以基因簇形式存在,串联复制是NBS 基因家族扩张的主要动力.系统发育分析表明标准NBS 基因形成两大分支,77 个标准NBS 基因有EST 表达支持.这为群体水平的抗病基因型筛选提供了本底信息,促进栽培香蕉分子抗病育种进程.

英文摘要:

In order to understand the function of nucleotide-binding site disease resistance genes (NBS) in Musa acuminata, based on recent publication of draft genome sequence of M. acuminata, the genome-wide NBS-encoding genes were identified, classified and chromosome located. The characteristics of gene duplications, phylogeny construction, distribution of adjacent promoter elements, expression evidences, and homologous function inferences were analyzed. The results showed that 125 NBS genes were identiifed from whole genome of M. acuminata, including 78 regular and 47 non-regular NBS genes. They were clustered into two clades phylogenetically, and most of the regular NBS-encoding genes resided in gene clusters and tandem duplications were predominant. Expression clues were found among 77 regular genes according to the public EST database. These would provide some fundamental information about the NBS-encoding genes in Musa species, and promote molecular disease-resistant breeding of cultivate banana.

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期刊信息
  • 《热带亚热带植物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院华南植物园 广东省植物学会
  • 主编:黄宏文
  • 地址:广州市天河区兴科路723号中国科学院华南植物园行政办公楼2楼
  • 邮编:510650
  • 邮箱:jtsb@scib.ac.cn
  • 电话:020-37252514
  • 国际标准刊号:ISSN:1005-3395
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1374/Q
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 中文核心期刊,广东省优秀科技期刊,执行《CD-CAJ》规范奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国生物科学数据库,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:11360