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MC1 R基因在中国草金鱼中的遗传变异及其进化分析
  • ISSN号:1000-2286
  • 期刊名称:《江西农业大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:S965.811.616[农业科学—水产养殖;农业科学—水产科学]
  • 作者机构:[1]江西农业大学动物科学技术学院,江西南昌330045
  • 相关基金:江西省教育厅项目(GJJ11086)和江西农业大学青年基金项目(09003306)
中文摘要:

鱼类的体色具有重要的观赏和经济价值,是重要的品种特征,属于高遗传力的质量性状,通常受单个基因或几个基因控制。 MC1R基因在黑色素合成过程中起着重要的调控作用,因此可能参与鱼体色的形成。研究利用中国草金鱼为材料,对MC1R基因进行全长序列扩增、SNPs搜寻及其突变位点的功能与进化分析。结果在MC1R基因整个序列上只鉴定到1个突变位点,即Exon 1 g.82 G>A,属于错义突变,该突变导致MC1R基因的第28个氨基酸发生改变(丙氨酸>苏氨酸)。进一步蛋白质结构预测和功能分析发现该突变导致MC1R蛋白形成了一个新的低复杂区。通过MC1R基因的分子进化树分析发现金鱼与鲫鱼、鲤鱼、斑马鱼等最先遗传分化出来,它们的遗传距离最近。 MC1R基因的Exon 1 g.82 G>A突变位点是否在金鱼体色的形成中起着重要调控作用还有待进一步研究。

英文摘要:

Coat color is the main characteristic of fish.It exhibits the important viewing and economical values of fish.Studies have showed that coat color is a high heritability of quality traits and is always affected by one single gene or more genes.MC1R gene plays an important role in melanin biosynthesis,so it is a candidate gene influencing fish coat color.In this study,the genetic variation and evolution of MC1R gene in Chinese goldfish and wild crucian carp were analyzed.As the result,only one mutation (Exon 1 g.82 G〉A) was identi-fied in the whole-length gene sequence.This SNP is a missense mutation leading to the transversion of Ala to Thr at the site of 28th amino acid of MC1R gene.The results from protein structure prediction and functional a-nalysis demonstrated that a new low complex area of MC1R protein was formed by the missense mutation.Phy-logenetic tree study showed that the genetic distance between Goldfish and Crucian carp,Carp and Zebrafish is shortest,owing to the earliest genetic differentiation.But whether Exon 1 g.82 G〉A of MC1R gene plays an im-portant role in fish coat color or not needs further investigation.

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期刊信息
  • 《江西农业大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:江西农业大学
  • 主办单位:江西农业大学
  • 主编:石庆华
  • 地址:江西省南昌市经开区志敏大道1101号江西农业大学期刊社
  • 邮编:330045
  • 邮箱:ndxb7775@sina.com
  • 电话:0791-83813246 83828010
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-2286
  • 国内统一刊号:ISSN:36-1028/S
  • 邮发代号:44-102
  • 获奖情况:
  • 中国期刊方阵双百期刊,国家期刊奖百种重点期刊,中国高校精品科技期刊,华东地区优秀期刊,江西省"名刊建设工程"期刊,江西省优秀期刊一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:20807