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基于查尔酮合酶基因探讨鲜卑花的种群动态历史与遗传分化
  • ISSN号:1673-5102
  • 期刊名称:《植物研究》
  • 时间:0
  • 分类:S727.34[农业科学—林木遗传育种;农业科学—林学]
  • 作者机构:[1]中国科学院高原生物适应与进化重点实验室,中国科学院西北高原生物研究所,西宁810001, [2]青海省作物分子育种重点实验室,西宁810001, [3]中国科学院大学,北京100049
  • 相关基金:国家自然科学基金(31270270;31110103911); 中国科学院知识创新工程重要方向性项目资助(KSCX2-EW-Z-1)
中文摘要:

以高山灌木鲜卑花为研究材料,收集其在中国全部分布区域内的13个居群共139个个体,以查尔酮合酶基因(CHS)的内含子区域为分子标记,探讨鲜卑花的种群动态历史、遗传分化的时间与成因。在鲜卑花中CHS共鉴定了29种单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.9248和0.007 545,遗传变异大;贝叶斯分析说明鲜卑花种内遗传分化的时间始于4.37 Ma左右。中性检验与歧点分布分析一致表明鲜卑花在近期经历了明显的居群扩张,估算的扩张时间在55.8 ka左右。研究结果表明鲜卑花在末次冰期间冰阶时期从冰期避难所向外经历了明显的居群扩张;而青藏高原的整体隆升导致的环境剧变,加剧了鲜卑花居群间的遗传分化。

英文摘要:

The demography history and genetic divergence of alpine shrub Sibiraea laevigata were studied with13 populations(139 individuals) collected in the whole distribution area in China,using the intron of chalcone sythase(CHS) as molecular marker. A total of 29 haplotypes were identified in S. laevigata,indicating high haplotype diversity and nucleotide diversity which were 0. 924 8 and 0. 007 545,respectively. Bayesian calculation illustrated the genetic divergence in S. laevigata began at around 4. 37 Ma,proved that the uplift of Qinghai-Tibetan Plateau triggered the genetic divergence. Neutrality test and mismatch distribution analysis consistently indicated the populations of S. laevigata had experienced recent population expansion at about 55. 8 ka.

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期刊信息
  • 《植物研究》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:东北林业大学
  • 主编:付玉洁
  • 地址:哈尔滨市和兴路26号东北林业大学
  • 邮编:150040
  • 邮箱:duanxihua828@163.com
  • 电话:0451-82190611
  • 国际标准刊号:ISSN:1673-5102
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1480/S
  • 邮发代号:14-77
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 被引量:13014