全日制专业学位研究生教育对于我国社会经济发展意义重大.实施4年多以来,在取得成效的同时也面临伦理困境.主要表现为:在全日制专业学位研究生教育的定位和认同上存在合法性危机、培养方式从根本上缺乏伦理层面的合理性支撑、个体理性与集体理性冲突等.需要采取相应措施消解这些困境,如提高全日制专业学位研究生教育的认同度,推进教育公平,深化培养模式改革等.