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喜马拉雅旱獭种群微卫星变异及遗传多样性
  • ISSN号:0250-3263
  • 期刊名称:《动物学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:Q341[生物学—遗传学] Q958[生物学—动物学]
  • 作者机构:[1]曲阜师范大学生命科学学院,曲阜273165, [2]中国科学院动物研究所,北京100101
  • 相关基金:国家科技攻关计划项目(No.2004BA718B08),国家973计划项目(No.2007CB109104),国家自然科学基金项目(N0.30670335),曲阜师范大学“十一五”计划省级重点建设项目
中文摘要:

为了解不同地理种群喜马拉雅旱獭(Marmota himalayana)的种群数量变化并探讨其内在的遗传学机制,通过构建部分基因组文库的方法筛选出8个高变异微卫星位点,根据微卫星位点的测序结果设计相应引物,PCR扩增检测了青藏高原4个地理种群(德令哈、乌兰、沱沱河、安多)喜马拉雅旱獭的遗传多态性及其种群结构。研究结果显示:8个位点在喜马拉雅旱獭种群中均为高度多态,观察等位基因数、有效等位基因数、多态信息含量分别为4.75、3.0332、0.6102;喜马拉雅旱獭种群总的期望杂合度和观察杂合度分别为0.670、0.699;3个喜马拉雅旱獭种群显著(P〈0.05)或极显著(P〈0.01)偏离H—W平衡状态,且这些偏离平衡的位点均由杂合过度导致(FIS〈0);喜马拉雅旱獭种群的部分位点已经偏离了突变一漂移平衡。结论:筛选出的8个微卫星位点适合于喜马拉雅旱獭种群遗传多样性的研究,所研究的喜马拉雅旱獭种群有较高的遗传多样性,安多地理种群在近期可能经历过瓶颈效应,种群数量曾经下降。

英文摘要:

To understand the changes in the number and the genetic mechanism of Himalayan Marmot (Marmota himalayana ), 4 geographical populations (Delhi, Ulan, Tuotuohe and Ando) living in the Qinghai-Tibet Plateau were investigated using microsatellite data. Eight microsatellite loci were selected as the molecular markers. The allele numbers, effective allele numbers and polymorphism information content were estimated to characterize genetic diversity. Tests to detect excess heterozygosity in a population at mutation-drift equilibrium were analyzed. The results show that all loci were high polymorphism, the allele numbers, effective allele numbers and polymorphism information content were 4.75, 3.033 2 and 0.610 2, respectively. The expected heterozygosity and the observed heterozygosity were 0.670 and 0.699. Tests of departures from Hardy-Weinberg equilibrium indicated many loci with significant heterozygosity excess at P 〈 0.05. As a conclusion, the Himalayan marmot population living in the Qinghai-Tibet Plateau has a relatively rich diversity; The Ando populations were significantly different from mutation-drift equilibrium with heterozygote excesses, they had suffered bottleneck effects in the past as well as the recent population decline.

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期刊信息
  • 《动物学杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国动物学会 中国科学院动物研究所
  • 主编:宋延龄
  • 地址:北京朝阳区北辰西路1号院5号
  • 邮编:100101
  • 邮箱:journal@ioz.ac.cn
  • 电话:010-64807162
  • 国际标准刊号:ISSN:0250-3263
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1830/Q
  • 邮发代号:2-422
  • 获奖情况:
  • 全国核心期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:13064