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结球甘蓝花粉类钙调素蛋白基因BoCML49的克隆及表达分析
  • ISSN号:0496-3490
  • 期刊名称:作物学报
  • 时间:2012.12.12
  • 页码:2162-2169
  • 分类:S852.65[农业科学—基础兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]西南大学园艺园林学院/南方山地园艺学教育部重点实验室,重庆市蔬菜学重点实验室,重庆400715
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31071802,31000908); 重庆市自然基金重点项目(2011BA1002); 中央高校基本科研业务费专项(XDJK2012B020,XDJK2009C126); 教育部高等学校博士点基金(20090182120003); 国家重点基础研究发展计划(973计划)项目(2012CB113900)资助
  • 相关项目:决定芥菜开花信号整合子命运的两个反式元件相互作用及其特异性介导结构域鉴定
中文摘要:

以结球甘蓝E1为材料,提取花粉萌发前和萌发后的混合花粉总蛋白,总蛋白双向电泳后通过MALDI-TOF-MS鉴定分析差异点,根据差异点分析结果,利用同源克隆得到甘蓝BoCML49基因707bp的cDNA片段。通过对BoCML49基因的qPCR分析表明其表达量在花粉萌发前约为萌发后的2.73倍,表明BoCML49基因在花粉萌发后表达下调。通过5-Race和3-Race分别得到550bp和721bp大小cDNA片段,最终得到结球甘蓝BoCML49全长cDNA序列,开放阅读框位于125~1078bp处,加尾信号(AATAAA)位于第1222bp处。通过cDNA推导得到的氨基酸序列分析表明,BoCML49编码317个氨基酸残基,预测分子量为33.51kD,pI为6.93,经Smart-embl预测其含2个重要的EF-hand结构,分别位于序列第150~178和第216~244位氨基酸残基处,预测结果显示其含有7个α-螺旋和10个β-折叠结构。系统发育树表明结球甘蓝BoCML49与拟南芥AtCML49和AtCML50的亲缘关系较近。BoCML49基因的原核表达得到37.55kD的融合蛋白。

英文摘要:

Calcium sensor proteins in plants play important roles in pollen germination and pollen tube growth processes. Calmodnlin-like (CML) protein of cabbage (Brassica oleracea L. var. capitata) was identified in the process of pollen germination in cabbage line E1 by two-dimensional electrophosis of the pollen total protein. The sequence of BoCML49 cDNA fragment was 707 bp. The expression analysis by qPCR showed that the BoCML49 gene was down-regulated when pollen germinated, 550 bp and 721 bp DNA fragments were obtained by 5'-Race and 3'-Race, respectively. We obtained BoCML49 gene with a total length of 1 343 bp by splicing, its open reading frame was located in the region from 125 to 1 078 bp, and contained a 124 bp 5' untranslated region (5'UTR) and a 265 bp 3'UTR, the polyadenylation signal (AATAAA) was located at 1 222 bp. The deduced BoCML49 protein contained 317 amino acids, with a MW of 33.51 kD and pI of 6.93. The structural analysis of BoCML49 though Smart-embl showed that it contained two critical functional domain EF-hand modifs, which located at the position of 150–178 and 216–244 amino acid residues, at the same time the ORF might contain seven α-helixes and ten β-sheets. The phylogenetic tree indicated that the BoCML49 had close genetic relationship with AtCML49 and AtCML50. Prokaryotic expression showed that the molecular mass of BoCML49 protein was about 37.55 kD.

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期刊信息
  • 《作物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国作物学会 中国农业科学院作物科学研究所
  • 主编:万建民
  • 地址:北京海淀区中关村南大街12号中国农业科学院
  • 邮编:100081
  • 邮箱:zwxb301@caas.cn
  • 电话:010-82108548
  • 国际标准刊号:ISSN:0496-3490
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1809/S
  • 邮发代号:82-336
  • 获奖情况:
  • 2002年-第三届中国科协优秀科技期刊二等奖,2002-2009年-百种中国杰出学术期刊,2004年获“全国优秀期刊一等奖”,2005年获第三届国家期刊奖提名奖,2009年评为“2008年度中国精品科技期刊”,2009年被评为“新中国60年有影响力的期刊”,2011年获"第二届中国出版政府奖期刊奖提名奖"
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:49369