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蛇足石杉HsCAS1基因克隆及序列分析
  • ISSN号:1674-3849
  • 期刊名称:世界科学技术(中医药现代化)
  • 时间:0
  • 页码:1159-1165
  • 分类:R373.21[医药卫生—病原生物学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所/濒危药材繁育国家工程实验室,100193, [2]西南大学园艺园林学院,重庆400716, [3]贵阳中医学院药学院,400716
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30900113):基于宏量ESTs的蛇足石杉转录组分析及石杉碱甲合成酶(HAS)基因的鉴定研究,负责人:罗红梅
  • 相关项目:基于宏量ESTs的蛇足石杉转录组分析及石杉碱甲合成酶(HAS)基因的鉴定研究
中文摘要:

本研究对蛇足石杉(Huperzia serrata)环阿屯醇合成酶(Cycloartenol synthase,CAS)基因HsCAS1编码区进行克隆及序列分析。根据本实验室已获得的蛇足石杉转录组数据,从中获得1条具有环氧角鲨烯环化酶保守结构域的编码CAS的转录本,采用RT-PCR方法获得该基因的编码区序列,并对HsCAS1蛋白进行理化性质、蛋白二级结构及三维结构预测分析。利用实时荧光定量PCR方法检测HsCAS1基因在蛇足石杉的根、茎、叶中的表达情况。序列分析表明,所克隆的HsCAS1基因编码区长为2,271 bp,编码756个氨基酸残基,HsCAS1与紫果冷杉(Abies magnifica)的CAS具有61%的序列相似性。生物信息学预测HsCAS1蛋白含有3个跨膜区,具有萜类环化酶等保守结构域,不含信号肽。HsCAS1在蛇足石杉的根中表达丰度高于茎和叶。本研究在国内外首次获得蛇足石杉HsCAS1基因的编码区序列,为进一步研究HsCAS1在石杉科植物甾醇合成途径中的功能及鉴定酶活性位点奠定基础。

英文摘要:

This study aimed to clone and analyze the open reading frame of cycloartenol synthase(CAS) from Huperzia serrata.After searching the transcriptome dataset of H.serrata,one unique sequence containing oxide squalene cyclases domain was discovered.The primers were designed according to the transcript sequence of HsCAS1 from the dataset.And then,the open reading frame of cycloartenol synthase was cloned by RT-PCR strategy from H.serrata.The bioinformatic analysis of this gene and its corresponding protein was performed.A cDNA clone(HsCAS1) encoding cycloartenol synthase(CAS) has been isolated from H.serrata by RT-PCR method.The cDNA contains a 2,271-bp open reading frame and encodes a predicted protein of 756 amino acids with high homology(61%) to Abies magnifica cycloartenol synthase.HsCAS1 contains three transmembrane regions and the conserved domain of terpenoid cylases,without signal peptide.HsCAS1 was more abundant in H.serrata root than in leaf and stem.This study cloned and analyzed cycloartenol synthase(CAS) gene from H.serrata for the first time.The result will provide a foundation for exploring the mechanism of sterol biosynthesis in H.serrata plants.

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期刊信息
  • 《世界科学技术:中医药现代化》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中科院科技政策与管理学研究所
  • 主编:陈凯先
  • 地址:北京市海淀区中关村东路55号中科院基础园区思源楼1203室
  • 邮编:100190
  • 邮箱:wst@casipm.ac.cn
  • 电话:010-62616352 62652762
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-3849
  • 国内统一刊号:ISSN:11-5699/R
  • 邮发代号:2-534
  • 获奖情况:
  • 2009年获得中国科学院科技期刊基金三等奖,2005-2011年连续获得科技部“中国科技核心期刊”奖,2007-2011年与ELSEVIER合作,成为ScienceDirect英...,2009年获得国家科技部等14部委主办的“2009传统医...
  • 国内外数据库收录:
  • 中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版)
  • 被引量:12547