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粉尘螨变应原第3组分基因克隆及序列多态性分析
  • ISSN号:1673-5234
  • 期刊名称:中国病原生物学杂志
  • 时间:2012
  • 页码:693-696
  • 分类:R384.4[医药卫生—医学寄生虫学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]盐城卫生职业技术学院检验医学教研室,江苏盐城224006
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(No.30660166,No.NS-FC81001330); 盐城市科技发展计划项目(No.YK2008079); 江苏省卫生厅招标课题(No.Z200914); 江苏省卫生职业技术教育研究立项课题(No.J200907); 江苏省“六大人才高峰”第六批项目
  • 相关项目:应用短肽阵列和噬菌体展示技术筛选尘螨变应原特异性IgE结合表位的研究
中文摘要:

目的获得粉尘螨变应原第3组分(Der f 3)的编码基因并了解其序列多态性。方法根据GenBank已公布的Der f 3核酸序列设计引物,用RT-PCR扩增获得其编码基因,插入pMD19-T载体,进行序列测定和多态性分析。结果获得粉尘螨变应原Der f 3编码基因为780bp。5株Der f 3基因cDNA克隆的核苷酸序列与参考序列(GenBankNo.AY 283291,GenBank No.D63858,GenBank No.EU312162,GenBank No.EU312163)相比,有19处cDNA序列发生突变,但有7处突变至少在3个cDNA克隆中序列一致;推导出氨基酸序列后进行比对,有11处氨基酸序列发生变化,有4处与上述7个位点相一致。结论获得了粉尘螨变应原Der f 3编码基因且证明其序列具有多态性,为进一步开展相关研究奠定了基础。

英文摘要:

Objectives To obtain the gene encoding the group 3 allergen of Dermatophagoides farinae(Der f 3) and ascertain its sequence polymorphism.Methods The total RNA of D.farinae was extracted,and the gene encoding Der f 3 was amplified by RT-PCR with primers designed in accordance with the sequence previously published in GenBank.The target gene was inserted into a pMD19-T plasmid and then sequenced and analyzed for its sequence polymorphism.Results The cDNA encoding Der f 3 had 780 base pairs(bp).Sequence analysis showed that there were nineteen mismatched nucleotides in five Der f 3 cDNA clones in comparison to four sequences previously published in GenBank(GenBank Accession No.AY283291,GenBank No.D63858,GenBank No.EU312162,and GenBank No.EU312163).Seven of these 19 mismatched nucleotides were conserved among three or more sequences of these nine sequences.When these nucleotide sequences were translated into amino acid sequences using Translate Tools on the ExPaSy web server,there were eleven incompatible amino acid(AA) positions.Four of these 11 incompatible amino acid(AA) positions were consistent with the 7 positions mentioned.Conclusion The gene encoding Der f 3 was obtained and displayed polymorphism,providing a foundation for further research.

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期刊信息
  • 《中国病原生物学杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:中华预防医学会 卫生部疾病控制司 山东省寄生虫病防治研究所
  • 主编:庄辉
  • 地址:山东省济宁市太白楼中路11号
  • 邮编:272033
  • 邮箱:www.cjpb.org
  • 电话:0537-2342934
  • 国际标准刊号:ISSN:1673-5234
  • 国内统一刊号:ISSN:11-5457/R
  • 邮发代号:24-81
  • 获奖情况:
  • 中华预防医学会、系列杂志优秀期刊,山东省优秀期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 英国农业与生物科学研究中心文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:8395