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植物酰基载体蛋白基因家族序列分析
  • ISSN号:1000-7091
  • 期刊名称:《华北农学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]石家庄市农林科学研究院,河北石家庄050041, [2]河北省小麦工程技术研究中心,河北石家庄050041
  • 相关基金:国家重点基础研究发展计划项目(NO.2009CB118300)
中文摘要:

以拟南芥酰基载体蛋白为查询序列,检索18个植物物种的基因组数据库,获得138个酰基载体蛋白基因和12个基因片段。植物酰基载体蛋白由1个基因家族编码,成员2~16个。植物酰基载体蛋白磷酸泛酰巯基乙胺结合位点(Ser)周围的氨基酸序列高度保守,该位点包含在保守的DSL基序中。植物酰基载体蛋白基因结构类型分为5种,其中类型III酰基载体蛋白基因所占比例最大。绝大多数植物酰基载体蛋白基因家族成员单独或2~4个成员分布在一条染色体上。在138个植物酰基载体蛋白基因中,19个具有不同剪接体。植物酰基载体蛋白基因家族成员可能起源于一个共同的祖先基因。

英文摘要:

Blasting target genome database of 18 plant species using eight A.thaliana acyl carrier proteins(ACPs) as queries,138 ACP cDNA sequences and 12 ACP fragments were isolated.Plant ACPs were encoded by one gene family including 2-16 members.The amino acid sequence surrounding the phosphopantetheine attachment sites(Ser) within the DSL motif was highly conserved in plant ACPs.Gene organization of plant ACPs can be grouped into five types and the type III was in the largest proportion.One or 2-4 members of ACP families were located on one chromosome in most plant genomes.Nineteen ACP genes can produce splicing variants in 138 plant ACPs.Plant ACP isoforms may be originated from one ancestral ACP gene.

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期刊信息
  • 《华北农学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:河北省农林科学院
  • 主办单位:山西省农业科学院 山西省农学会 河南省农业科学院 河南省农学会 天津市农业科学院 天津市农学会等
  • 主编:王海波
  • 地址:石家庄市和平西路598号
  • 邮编:050051
  • 邮箱:hbnxb@163.com
  • 电话:0311-87652166
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-7091
  • 国内统一刊号:ISSN:13-1101/S
  • 邮发代号:18-10
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,全国综合性农业核心期刊,中国科学引文数据库核心期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:32962