位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
光皮桦木质部cDNA—AFLP技术体系的建立及应用
  • ISSN号:1000-1522
  • 期刊名称:《北京林业大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:S718.43[农业科学—林学]
  • 作者机构:[1]浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31100494)、浙江省农业科技重点项目(2011C12014)、浙江农林大学研究生科研创新基金项目(3122013240217).
中文摘要:

为了挖掘光皮桦材性相关基因,本研究以光皮桦木质部为材料,通过对RNA的提取、cDNA的反转录及纯化的对比分析,以及选扩体系优化等,建立了相应的cDNA-AFLP体系。结果表明:采用CTAB和RNAiso试剂相结合的方法得到的RNA质量较好,cDNA经纯化后选扩效果明显变好。选扩体系为:4.0μL预扩产物(稀释40倍)、1.6μL的引物(10.0μmol/L)、0.2μL的dNTP(2.5mmol/L)、0.4μL的Mg2+(25.0mmol/L),以及0.2μL的TaqDNA聚合酶(5U/μL)。进一步以来自不同木质化茎段的cDNA为模板,筛选出31对扩增效果较好的引物组合,同时分离出一些差异表达的基因片段,经测序后探讨了其在木质化发育过程中可能的功能。

英文摘要:

To investigate genes related to wood property in Betula luminifera, a suitable cDNA-AFLP reaction system for xylem tissues of B. luminifera was found in this study based on the comparative analysis of main procedures, including RNA extraction, reverse transcription and purification, and optimizing of selective amplification system. The results showed that CTAB method in combination with the RNAiso reagent was appropriate for RNA isolation of xylem, and cDNA purifying was an essential step after its synthesis. The optimal conditions for selective amplification were obtained as follows: the amount of 4.0 μL of 40 times-diluted preamplification products, 1.6μL of primer( 10.0μmol/L) , 0.2μL of dNTP (2.5mmol/L), 0.4 μL of Mg2+ (25.0 mmol/L), and 0.2 μL of Taq polymerase(5 U/μL). In addition, 31 out of 64 primer pairs were screened by application of different lignification tissues in the selective amplification. Differentially expressed transcripts during the lignifieation were identified, and their function was analysed.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《北京林业大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:北京林业大学
  • 主编:尹伟伦
  • 地址:北京市海淀区清华东路35号
  • 邮编:100083
  • 邮箱:bldxeb@bjfu.edu.cn
  • 电话:010-62337673
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-1522
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1932/S
  • 邮发代号:82-304
  • 获奖情况:
  • 中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:30004