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油桐LEC1基因的cDNA克隆与序列分析
  • ISSN号:1003-8981
  • 期刊名称:经济林研究
  • 时间:0
  • 页码:-
  • 分类:S602[农业科学—园艺学] S794.3[农业科学—林木遗传育种;农业科学—林学]
  • 作者机构:[1]中南林业科技大学经济林培育与保护省部共建教育部重点实验室,湖南长沙410004, [2]中南林业科技大学林业生物技术湖南省重点实验室,湖南长沙410004, [3]中南林业科技大学经济林培育与利用湖南省2011协同创新中心,湖南长沙410004
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31170640)
  • 相关项目:油桐桐酸合成酶调控基因的筛选与研究
中文摘要:

为了解LEC1(Leafy Cotyledon 1)基因对油桐油脂合成过程的调控机理,以油桐种仁转录组数据库中基因的部分c DNA序列为基础,采用RT-PCR技术从油桐种子中克隆LEC1基因的全长c DNA,并对其进行序列分析。油桐LEC1基因全长c DNA为1 152 bp,编码区为729 bp(142~870),编码243个氨基酸,5′端非编码区和3′端非编码区分别为141 bp和263 bp。该基因编码蛋白质的相对分子质量为27 025.4 Da,理论等电点为6.97;蛋白二级结构以不规则卷曲和α螺旋为主,是不具有跨膜结构的膜外蛋白。经对比发现,油桐LEC1具有典型的HAP3结构特点,在不保守的N端和C端中间有1个十分保守的结构域,与拟南芥、玉米、麻风树、黄连木等的LEC1氨基酸序列高度同源。

英文摘要:

In order to learn regulation mechanism of LEC1 gene(Leafy Cotyledon 1) to tung oil synthesis, the full-length c DNA of LEC1 gene was cloned from Vernicia fordii seeds by RT-PCR method on the basis of a part of c DNA sequences of the gene in transcription database of V. fordii kernel, and the sequences were analyzed. The full-length c DNA of LEC1 gene in V. fordii was 1 152 bp, ORF consisting of 729 bp(142-870) coded 243 amino acid, and 5′ UTR and 3′ UTR were 141 bp and 263 bp respectively. The relative molecular mass of coded protein by LEC1 gene was 27 025.4 Da, and its theoretical isoelectric point was 6.97. The predicted second structure of the protein mainly consisted of random coil and alpha helix, and had no transmembrane domain. The results of phylogenetic investigation revealed that LEC1 in V. fordii had typical HAP3 structure characteristics and had a very conservative structure domain between N end and C end, and the coded protein was highly homologous with those of other species.

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期刊信息
  • 《经济林研究》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:湖南省教育厅
  • 主办单位:中南林业科技大学
  • 主编:谭晓风
  • 地址:湖南省长沙市韶山南路498号中南林业科技大学期刊社
  • 邮编:410004
  • 邮箱:jjlyj-csfu@163.com
  • 电话:0731-5658526
  • 国际标准刊号:ISSN:1003-8981
  • 国内统一刊号:ISSN:43-1117/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:11076