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二价金属离子与YycFN相互作用的NMR研究
  • ISSN号:1000-4556
  • 期刊名称:《波谱学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:O482.53[理学—固体物理;理学—物理]
  • 作者机构:[1]中国科学院生物磁共振重点实验室,波谱与原子分子物理国家重点实验室,武汉磁共振中心(中国科学院武汉物理与数学研究所),湖北武汉430071, [2]中国科学院大学,北京10049
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(21173257)
中文摘要:

YycGF最早发现于枯草芽孢杆菌,是与细胞存活密切相关的双组分信号转导系统存在于少量低鸟嘌呤和胞嘧啶(G+C)含量的革兰氏阳性菌中,包括金黄色葡萄球菌和肺炎链球菌等人类病原菌,在外界环境刺激下,胞膜上的组氨酸激酶YycG通过自身组氨酸磷酸化活化,将磷酸根转移至反应调节蛋白YycF的N端调节区(YycFN)使之磷酸化,调控下游基因表达,实现特定细胞应答反应.二价金属离子在双组分信号转导系统反应调节蛋白的磷酸化过程中起着非常关键的作用,但它们与YycFN相互作用的机制尚不清楚.该文利用液体核磁共振(NMR)方法研究了Ca^2+、Mg^2+两种离子与YycFN的相互作用,对详细的相互作用界面进行了分析,并计算了Ca^2+、Mg^2+与YycFN的解离常数(Kd).发现金属离子的关键作用位点是Asp9、Asp16和Asp53等残基,蛋白的整体构象也发生了一定变化,为阐明二价金属离子在反应调节蛋白信号转导过程中的作用机制提供了重要线索.

英文摘要:

YycGF, originally identified in Bacillus subtilis, is recognized as a crucial two-component signal transduction system closely associated with cell viability. It is highly conserved in low G+C Gram-positive bacteria, including Staphylococcus aureus, Streptococcus pneumoniae and other human pathogens. The histidine kinase (HK) YycG senses extracellular or intracellular signals and phosphorylates its cognate response regulator (RR) YycF, which in turn recognizes sequence specific regions on the bacterial chromosome and regulates the expression of certain genes. The presence of a divalent metal ion is essential for phosphoryl group transfer. Here, we presented a metal ion binding study of the response regulator YycF (YycFN) from Bacillus subtilis using NMR spectroscopy. The metal ions Ca^2+ and Mg^2+ induced severe chemical shift changes in YycF backbone resonances, involving mainly the Asp9, Asp16 and Asp53 residues. Furthermore, the binding affinities of Ca^2+ and Mg^2+ with YycFN were compared. The results provide important clues for understanding the conformational change of YycFN upon metal ion binding before its phosphorylation.

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期刊信息
  • 《波谱学杂志》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院武汉物理与数学研究所 中国物理学会波谱学专业委员会
  • 主编:刘买利
  • 地址:湖北省武汉市武昌小洪山西区30号
  • 邮编:430071
  • 邮箱:magres@wipm.ac.cn
  • 电话:027-87198791
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-4556
  • 国内统一刊号:ISSN:42-1180/O4
  • 邮发代号:38-313
  • 获奖情况:
  • 1992 年获国家科委、中宣部、新闻出版署首届优秀...,获中国科1996年获中国科学院优秀期刊三等奖,1999年获第三届湖北省优秀期刊奖 ,并被列为湖北...,2001年获第四届湖北省优秀期刊奖,2006年获第五届湖北省优秀期刊奖,2008年获第六届湖北省优秀期刊奖,2010年获第七届湖北省优秀期刊奖---湖北省专业技...,2013年获第八届湖北省优秀期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:2740