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苏云金芽胞杆菌YBT-1520中SigL及其增强子结合蛋白的结构与功能分析
  • ISSN号:1006-687X
  • 期刊名称:应用与环境生物学报
  • 时间:2012.4.4
  • 页码:315-319
  • 分类:Q343.2[生物学—遗传学]
  • 作者机构:[1]华中农业大学生命科学技术学院农业微生物学国家重点实验室 微生物农药国家工程研究中心,武汉430070
  • 相关基金:国家自然科学基金重点项目(No.30930004)资助
  • 相关项目:苏云金芽胞杆菌伴胞晶体形成和苏云金素合成的代谢网络研究
中文摘要:

为揭示SigL及其增强子结合蛋白(EBPs)在苏云金芽胞杆菌(Bt)中的调控功能,在全基因组测序的基础上,采用生物信息学方法,对YBT-1520菌株的SigL及其EBPs的结构和功能进行深入分析.结果表明,YBT-1520基因组中存在1个SigL和6个EBPs,而且EBPs在结构上具有丰富的多样性,包含了EBPs的所有可能的结构域组织类型.SigL所调控的基因涉及11个假定的COG代谢途径,其中包括能量代谢、氨基酸代谢、翻译与细胞周期等.根据EBPs在基因组的位置推测,YBT-1520的EBPs参与γ-氨基丁酸代谢途径、精氨酸代谢途径、支链脂肪酸降解途径、多糖分解代谢等代谢途径的调控.本研究将为揭示Bt杀虫晶体蛋白大量表达的调控机制提供新的思路.

英文摘要:

To reveal the regulatory functions of SigL and its enhancer-binding proteins(EBPs) in Bacillus thuringiensis,the structure and function of SigL and its EBPs of YBT-1520 strain were in depth analyzed through bioinformatics methods after the whole genome sequencing.The results indicated that there were one and six coding genes for SigL and EBPs in YBT-1520 genome,respectively.Furthermore,the EBPs displayed rich structural diversity and possessed all organization types of EBPs domains.The genes regulated by SigL should be related with 11 putative COG metabolism pathways,including energy metabolism,amino acid metabolism,translation and cell cycle.According to the location of EBPs in YBT-1520 genome,some EBPs were predicted to regulate the metabolism pathways of γ-aminobutyric acid and arginine,and the degradation of branched chain fatty acid and polysaccharide.This study will provide a new research direction on the regulatory mechanisms for high expression of insecticidal crystal proteins.

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期刊信息
  • 《应用与环境生物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院成都生物研究所
  • 主编:吴宁
  • 地址:成都市人民南路4段9号
  • 邮编:610041
  • 邮箱:biojaeb@cib.ac.cn
  • 电话:028-82890917
  • 国际标准刊号:ISSN:1006-687X
  • 国内统一刊号:ISSN:51-1482/Q
  • 邮发代号:62-15
  • 获奖情况:
  • 中国农业期刊金犁奖学术类一等奖(2006),* 中国期刊方阵双效期刊(2002年),* 四川省第二届优秀期刊(2000年),* 四川省一级学术期刊(1998年)
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:23016