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甜菜亚硝酸还原酶(NiR)基因的克隆与表达分析
  • ISSN号:0496-3490
  • 期刊名称:作物学报
  • 时间:2011.8.8
  • 页码:1406-1414
  • 分类:Q51[生物学—生物化学]
  • 作者机构:[1]东北农业大学农学院,黑龙江哈尔滨150030
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31071361)资助
  • 相关项目:甜菜NiR(EC 1.7.7.1)基因的克隆、特性及其与NR的偶联调节
中文摘要:

以甜菜品种甜研7号叶片的cDNA为模板,采用RT-PCR和3′/5′RACE技术,获得了编码亚硝酸还原酶基因(NiR)的cDNA全序列2014bp,包含有1830bp的开放阅读框,编码599个氨基酸。所推导的氨基酸序列与菠菜及拟南芥NiR编码的氨基酸序列均具93%的同源性。生物信息学分析表明,甜菜NiR具有完整的NiR蛋白结构,含血红素蛋白β-化合物区域和4Fe-4S区域,并利用分析软件预测其三维结构。实时荧光定量结果显示,在以0、10、20、30、40、50、80和160mmol L-1NO3–-N处理72h的试验中,50mmol L-1处理可使甜菜NiR的表达量达到最大;以0、2、4、8、16、32、64和128mmol L-1NH4+-N处理48h的试验表明,8mmol L-1和64mmol L-1处理条件下甜菜NiR表达量相对较高。硝态氮和铵态氮不同配比处理48h的试验中,NO3–-N和NH4+-N比例为80∶20可使甜菜NiR的表达量达到最大;在氮素诱导的基础上,蛋白抑制剂放线菌酮处理9h,随着处理浓度的增大,NiR的表达量逐渐下降;不同浓度NO2–处理的试验中,40mmol L–1处理下NiR的表达量最大。

英文摘要:

The nitrite reductase (NiR) gene was cloned using RT-PCR and 3′/5′RACE techniques. The cDNA of NiR gene isolated from sugarbeet was 2 014 bp containing a 1 830 bp opening-reading frame (ORF), encoding 599 amino acids. Further comparison showed that NiR gene had high homology to both of Spinacia oleracea NiR gene and Arabidopsis thaliana NiR gene, which was 93%.The predicted NiR protein found to have a hemoprotein beta-component (ferrodoxin-like), and 4Fe-4S region, its 3D structure was predicted by analysis software. Real time PCR analysis showed that when using 0, 10, 20, 30, 40, 50, 80, and 160 mmol L–1 NO3–-N treated for 72 hours, the expression of NiR gene was the highest at 50 mmol L–1;when using 0, 2, 4, 8, 16, 32, 64, and 128 mmol L–1 NH4+-N treated for 48 hours, the expression of NiR gene showed two peaks at 8 mmol L–1 and 64 mmol L–1, re-spectively. Furthermore, in experiments treated with different ratios of NO3–-N to NH4+-N for 48 h, the expression of NiR gene was the highest when the ratio was 80:20. Cycloheximide 9 h treatment experiments showed that NiR gene expression decreased with increasing the treating concentration. NO2–treatments indicated that the maximum expression of NiR gene was induced by 40 mmol L–1 NO2–.

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期刊信息
  • 《作物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国作物学会 中国农业科学院作物科学研究所
  • 主编:万建民
  • 地址:北京海淀区中关村南大街12号中国农业科学院
  • 邮编:100081
  • 邮箱:zwxb301@caas.cn
  • 电话:010-82108548
  • 国际标准刊号:ISSN:0496-3490
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1809/S
  • 邮发代号:82-336
  • 获奖情况:
  • 2002年-第三届中国科协优秀科技期刊二等奖,2002-2009年-百种中国杰出学术期刊,2004年获“全国优秀期刊一等奖”,2005年获第三届国家期刊奖提名奖,2009年评为“2008年度中国精品科技期刊”,2009年被评为“新中国60年有影响力的期刊”,2011年获"第二届中国出版政府奖期刊奖提名奖"
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:49369