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泥河湾大长梁遗址和马圈沟Ⅰ文化层放线菌的分离及系统发育分析
  • ISSN号:1674-568X
  • 期刊名称:《基因组学与应用生物学》
  • 时间:0
  • 分类:Q[生物学]
  • 作者机构:河北大学生命科学学院河北省微生物多样性研究与应用实验室,保定071001
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31370061)资助
中文摘要:

为分析泥河湾盆地大长梁遗址和马圈沟Ⅰ文化层中可培养放线菌的物种多样性,本实验通过平板稀释涂布法对该区域土样进行放线菌的物种分离,得到197株放线菌纯培养物。采用链霉菌属特异引物对放线菌纯培养物进行初步鉴定,确定143株放线菌归属于链霉菌属。对未被鉴定的54株放线菌进行16S rDNA全序列测定并分析其系统发育关系。最终,将197株放线菌归属于放线菌纲下的5个亚目,6个科,10个属。其中,马圈沟Ⅰ文化层的分离菌株12-9与Nocardioides albus KCTC 9186T之间的16S rDNA序列相似性是93.73%,可能是一个潜在新属;大长梁遗址的分离菌株18-64与Haloglycomyces albus YIM 92370T的16S rDNA序列相似性是93.64%,可能是一个潜在新属。

英文摘要:

In order t o analyze the species diversity of cultivable actinomycetes isolated from Dachangliang ancient site and Majuangou Ⅰ cultural stratum in Nihewan Basin, soil samples in this area were under species isolation of actinomycetes by dilution plate method, to obtain 197 strains of actinomycetes in pure culture. These pure cultures of actinomyces were preliminarily identified by the specific primers of Streptomyces and the results showed that 143 strains of actinomycetes belong to Streptomyces. 16S rDNA sequence determination was used for the phylogenetic analysis of the remaining 54 unidentified strains. Finally, the 197 strains of actinomycetes belong to 5 suborders, 6 families and 10 genera. Among these strains, the 16S rDNA sequence similarity of the strain 12-9isolated from Majuangou Ⅰ cultural stratum and the strain Nocardioides albus KCTC 9186 T is 93.73%, which suggests that it may be a potential new genus. The 16S rDNA sequence similarity of the strain 18-64 isolated from Dachangliang ancient site and the strain Haloglycomyces albus YIM 92370 Tis 93.64%, which suggests that it may belong to a potential new genus.

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期刊信息
  • 《基因组学与应用生物学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广西大学
  • 主办单位:广西大学
  • 主编:朱玉贤
  • 地址:广西南宁市大学东路100号广西大学西校园《基因组学与应用生物学》编辑部111室
  • 邮编:530004
  • 邮箱:gab@hibio.org 571388455@qq.com
  • 电话:0771-3239102
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-568X
  • 国内统一刊号:ISSN:45-1369/Q
  • 邮发代号:48-213
  • 获奖情况:
  • 全国优秀高校学校自然科学学报,教育部优秀科技期刊,广西优秀科技期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:4299