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基于吲哚类的ROCK激酶抑制剂定量构效关系的研究
  • ISSN号:1000-9035
  • 期刊名称:《分子科学学报:中英文版》
  • 时间:0
  • 分类:O641[理学—物理化学;理学—化学]
  • 作者机构:[1]大连理工大学化工学院,辽宁大连116024, [2]中国科学院大连化学物理研究所药物资源开发研究组,辽宁大连116023
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(11201049)
中文摘要:

基于计算生物学方法对61个ROCK激酶靶标分子建立三维定量构效关系(3DQSAR)模型.在基于配体叠合的基础上,发现CoMSIA中2个场组合(位阻场和疏水场)为最好的模型(Q2=0.509,R2ncv=0.987,SEE=0.131,F=287.999和R2pre=0.837).基于此模型基础上的三维等势线图形象地说明了在各个位置增加疏水性的大取代基或者亲水性基团有利于提高分子的生物活性.此外,分子对接模拟结果显示了氨基酸Glu170,Met172和Asp232在受体调节剂中发挥着重要作用.这些结果能够帮助深入了解ROCK激酶的作用机理,并且能够为今后的药物设计提供新的方向.

英文摘要:

For the first time,via comparative molecular field analysis(CoMFA)and comparative molecular similarity indices analysis(CoMSIA),a set of ligand-and receptor-based 3D-QSAR models were carried out to explore the structure-activity correlation of 61 ROCK promising inhibitors.Based on the ligand-based alignment,an optimal CoMSIA model(SH)was obtained with good predictive power of Q2=0.509,R2ncv=0.987,SEE=0.131,F=287.999 and R2pred=0.837.The 3Dcontour maps suggested that the compounds substituted on special position with bulky hydrophobic or hydrophilic groups can enhance the biological activity.Furthermore,the docking analysis showed that Glu170,Met172 and Asp232which formed three H-bonds are crucial for ROCK receptor.The present work provides useful guidelines for future structural modifications of this class of compounds,which would assist the development of superior ROCK inhibitors.

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期刊信息
  • 《分子科学学报:中英文版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:
  • 主办单位:中国化学会
  • 主编:方维海
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  • 邮编:130024
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  • 电话:0431-85099521
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-9035
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1662/O4
  • 邮发代号:12-82
  • 获奖情况:
  • 中文化学类核心期刊、 "《CAJ-CD规范》执行优秀期...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:2880