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基于遗传算法和模拟退火的插值马氏模型用于真核生物启动子识别
  • ISSN号：1001-7402
  • 期刊名称：《模糊系统与数学》
  • 时间：0
  • 分类：O159[理学—数学;理学—基础数学]
  • 相关基金：国家自然基金资助项目(No.60375023).资助项目(102028)
作者： 罗强, 杨文强, 刘普寅
关键词： 启动子识别, 插值马氏模型(IMC), 遗传算法(GA), 模拟退火算法(SA)
中文摘要：

启动子识别是生物信息学领域极具挑战的问题.本文在IMC(Interpolated Markov Chin)的框架下考虑碱基的插入与缺失,采用SA(Simulated Annealing)训练转移概率,以增加模型的鲁棒性,利用GA(Genetic Algorithm)优化IMC插值系数,以克服梯度算法易于陷入局部极值点的缺陷,最后将该模型用于启动子识别,识别率在测试集达到86%.

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期刊信息
  • 《模糊系统与数学》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:国防科技大学
  • 主办单位:国防科技大学理学院 国防科技大学理学院
  • 主编：刘应明
  • 地址：湖南长沙国防科技大学理学院
  • 邮编：410073
  • 邮箱：fuzzysys@cfsm.cn
  • 电话：0731-84576220
  • 国际标准刊号：ISSN：1001-7402
  • 国内统一刊号：ISSN：43-1179/O1
  • 邮发代号:42-180
  • 获奖情况:
  • 美国《数学评论》（Mathematical Reviews）核心引...,中国科技论文统计源期刊,《中国科学引文数据库》来源期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国数学评论（网络版）,德国数学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊（2004版）,中国北大核心期刊（2008版）,中国北大核心期刊（2011版）,中国北大核心期刊（2014版）
  • 被引量:8133