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DNA条形码专用R包及其主要功能简介
  • ISSN号:1674-0858
  • 期刊名称:《环境昆虫学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q963[生物学—昆虫学]
  • 作者机构:[1]江苏省农业科学院宿迁农科所,江苏宿迁223800, [2]首都师范大学生命科学学院,北京100048
  • 相关基金:国家自然科学基金青年科学基金项目(31601877)
中文摘要:

S_(PIDER)和BarcodingR软件包作为DNA条形码研究的专用R软件包,整合了基于DNA条形码的物种识别算法和数据分析策略,避免了各种非商业用途软件的局限性,为DNA条形码的研究提供了便捷性和可操作性。本文对SPIDER和BarcodingR软件包的主要功能进行整体介绍,并以西藏夜蛾科COI、松毛虫属ITS等数据为例,进行主要函数的演示分析,希望为昆虫DNA条码的应用分析提供帮助。

英文摘要:

S_(PIDER_ and BarcodingR,are new R packages implementing a number of useful functions for DNA barcoding analyses and associated research into species speciation. Both of them avoid limitations of noncommercial computer programs and provide convenience and operability for user. Here we demonstrated the main functions of the two packages with Tibet moth,pine moth datasets.

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期刊信息
  • 《环境昆虫学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:广东省科学技术协会
  • 主办单位:广东省昆虫学会 中国昆虫学会
  • 主编:庞义
  • 地址:广州新港西路105号
  • 邮编:510260
  • 邮箱:J.Env.Ent@gdei.gd.cn
  • 电话:020-84456131
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-0858
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1640/Q
  • 邮发代号:46-18
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:2216