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基于前馈人工神经网络的miRNA预测
  • ISSN号:1673-629X
  • 期刊名称:计算机技术与发展
  • 时间:2012
  • 页码:19-22
  • 分类:TP183[自动化与计算机技术—控制科学与工程;自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
  • 作者机构:[1]济南大学信息科学与工程学院,山东济南250022
  • 相关基金:国家自然科学基金(61070130)
  • 相关项目:基于比较基因组学和计算智能的禾本科牧草功能基因的发掘和表达调控研究
中文摘要:

microRNA(miRNA)是一类长度约为20—24个核苷酸保守的非编码小分子RNA,如何能准确预测miRNA一直是生物信息学的难点之一。文中提出一种新的预测方法一粒子群优化的前馈人工神经网络预测miRNA,从331(阴性数据168,阳性数据163)个样本组成的数据集中提取每个样本的36维特征向量训练人工神经网络模型,并用训练好的模型对不同的测试集进行测试,结果表明这种方法平均预测精度达到91.0%,高于传统的SVM预测方法,从而为miRNA预测提供了一个新的研究方向。

英文摘要:

microRNA(miRNA) is a class of 20 - 24 long nucleotides conserved non-coding small RNA. How to predict miRNA accurately is one of the difficulties in bioinformatics. A new predicting method has been proposed in this paper, that is, particle swarm opti- mized feedforward artificial neural network. Use 36 feature extracted from the data set comprised of 331 samples to train the neural network model,which used to test new data-sets get a prediction accuracy up to 91.0%. This indicates that the model can be used as a new direction to predict miRNA.

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期刊信息
  • 《计算机技术与发展》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:陕西省工业和信息化厅
  • 主办单位:陕西省计算机学会
  • 主编:王守智
  • 地址:西安市雁塔路南段99号
  • 邮编:710054
  • 邮箱:ctad@vip.163.com
  • 电话:029-85522163
  • 国际标准刊号:ISSN:1673-629X
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1450/TP
  • 邮发代号:52-127
  • 获奖情况:
  • 《CAJ-CD规范》执行优秀期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 中国中国科技核心期刊
  • 被引量:21263