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基因Ⅶ型新城疫病毒SYBR Green Ⅰ实时荧光定量PCR检测方法的建立
  • ISSN号:1674-6422
  • 期刊名称:《中国动物传染病学报》
  • 时间:0
  • 分类:S852.695.5[农业科学—基础兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]中国农业科学院上海兽医研究所,上海200241, [2]南京农业大学动物医学院,南京210095, [3]四川农业大学动物医学院,雅安625014
  • 相关基金:农业公益性行业科研专项课题(201003012); 国家高科技研究发展计划863计划(2011AA10A200)
中文摘要:

根据Ⅶ型新城疫病毒基质蛋白基因保守序列设计并合成特异性引物,建立快速检测Ⅶ型新城疫病毒的实时荧光定量RT-PCR方法。通过RT-PCR方法克隆Ⅶ型新城疫病毒M基因靶序列,并将其连入T-Easy载体,制备阳性标准品,优化反应条件,以10倍系列稀释的标准品绘制标准曲线,其相关系数为0.999。检测结果显示,该方法的灵敏度可达100 copies/μL,而且特异性良好,除Ⅶ型新城疫病毒外,对Ⅱ型/Ⅲ型/IV型/Ⅸ型新城疫病毒、H5亚型禽流感病毒、H9亚型禽流感病毒、鸡传染性支气管炎病毒检测结果均为阴性。本研究所建立的检测方法重复性好,批内和批间变异系数均小于5%。对40份实验感染样品的检测结果表明,其检出率为95%,而常规RT-PCR方法检出率仅为70%,表明该方法比常规RT-PCR检测方法灵敏度更高、特异性更强。

英文摘要:

The real time SYBR Green Ⅰ fluorescence quantitative reverse transcription polymerase chain reaction(rRT-PCR) assay based on conserved region of matrix gene was developed for rapid detection of genotype Ⅶ Newcastle disease virus.The target sequence of M gene was cloned into the T-easy vector and a series of diluted recombinant plasmids were used to generate standard curve.The rRT-PCR assay had a detection limit of 100 copies of target DNA per-reaction and a correlation coefficient of 0.999.The assay showed good specificity and did not cross react with other viruses including genotype(Ⅱ,Ⅳ,Ⅸ) Newcastle disease virus,H5 Avian influenza virus,H9 Avian influenza virus and Infection bronchitis virus.The variation coefficients of intra assay were below 5%,which indicated good reproducibility.Forty experimentally infected samples were validated by the assay.The results showed that the detection rate was 95% compare with 70% by conventional RT-PCR.It showed better sensitivity and specificity of rRT-PCR than conventional RT-PCR.

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期刊信息
  • 《中国动物传染病学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院上海兽医研究所
  • 主编:童光志
  • 地址:上海市闵行区紫月路518号
  • 邮编:200241
  • 邮箱:bianjibu@shrri.ac.cn
  • 电话:021-34293142
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-6422
  • 国内统一刊号:ISSN:31-2031/S
  • 邮发代号:4-748
  • 获奖情况:
  • 第二届全国畜牧兽医优秀期刊二等奖,首届《CAJ-CD规范》执行优秀奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:1517