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十种臂尾轮虫12S rDNA基因序列的PCR扩增及分析
  • ISSN号:1001-2443
  • 期刊名称:《安徽师范大学学报:自然科学版》
  • 分类:Q951.3[生物学—动物学]
  • 作者机构:[1]安徽师范大学生命科学学院、安徽省高校生物环境与生态安全省级重点实验室、重要生物资源保护和利用研究安徽省重点实验室,安徽芜湖241000
  • 相关基金:国家自然科学基金(31200324); 安徽省自然科学基金(1208085QC47); 国家级大学生校外实践教育基地大学生创新训练计划项目
中文摘要:

通过对角突臂尾轮虫、尾突臂尾轮虫、裂足臂尾轮虫、剪形臂尾轮虫、方形臂尾轮虫、壶状臂尾轮虫、红臂尾轮虫、镰形臂尾轮虫、萼花臂尾轮虫和十指臂尾轮虫等十种臂尾轮虫和矩形龟甲轮虫的12S rDNA基因进行扩增和序列测序,结合Genbank中两种褶皱臂尾轮虫的125rDNA序列,使用MEGA软件构建这13种轮虫系统发生树(NJ树),探讨了12种臂尾轮虫之间的系统关系.结果表明:本研究所涉及的轮虫12S rDNA序列差异百分比均值为34.41%,可作为分子标记应用于轮虫属内种间系统关系研究;系统树支持将十指臂尾轮虫、裂足臂尾轮虫归属于臂尾轮属;壶状臂尾轮虫和红臂尾轮虫是两个独立的种.

英文摘要:

Partial sequences of 12 S rDNA gene from Brachionus angularis,B. caudatus,B. diversicornis,B.forficula,B. quadridentatus,B. urceolaris,B. rubens,B. falcatus,B. calyciflorus,B. patulus and Keratella quadrata were amplified and sequenced. Combined with 12 s rDNA of B. plicatilis and B. koreanus from Genbank,phylogenetic tree were built based on neighbor-joining( NJ) method with MEGA software,aiming to reveal their phylogenetic relationships and resolve some taxonomic issues. The results showed that the percentage of divergence for 12 S rDNA gene sequences in 13 samples was averaged 34. 41%. Thus,the 12 S rDNA gene was suitable for exploring the phylogeny and evolution in rotifera. The NJ tree supported that B. patulus and B. diversicornis belong to the genus Brachionus,while B. urceolaris and B. rubens are two potential species.

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期刊信息
  • 《安徽师范大学学报:自然科学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:安徽省教育厅
  • 主办单位:安徽师范大学
  • 主编:王伦
  • 地址:安徽省芜湖市北京东路1号
  • 邮编:241000
  • 邮箱:xbysd@mail.ahnu.edu.cn
  • 电话:0553-3869521 3869260
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-2443
  • 国内统一刊号:ISSN:34-1064/N
  • 邮发代号:26-207
  • 获奖情况:
  • 安徽省高等院校优秀学报,安徽省优秀高校学报
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),德国数学文摘,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版)
  • 被引量:6339