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麦芽酚与小牛胸腺DNA的沟槽结合作用
  • ISSN号:1006-0464
  • 期刊名称:《南昌大学学报:理科版》
  • 时间:0
  • 分类:O657.3[理学—分析化学;理学—化学]
  • 作者机构:南昌大学食品科学与技术国家重点实验室,江西南昌330047
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31460422); 江西省自然科学基金项目(20143ACB20006); 高等学校博士点专项科研基金项目(20123601110005); 食品科学与技术国家重点实验室目标导向课题(SKLF-ZZA-201612)
中文摘要:

在生理酸度条件下(pH 7.4),运用紫外-可见吸收光谱法、荧光光谱法、圆二色光谱法(CD)和红外光谱法(FT-IR)并结合粘度实验和熔点测量,研究了麦芽酚(MAL)与小牛胸腺DNA(ctDNA)之间的结合性质和结合模式。实验结果表明,MAL与ctDNA的结合未引起ctDNA的熔点和粘度产生明显变化,NaCl浓度的增加,对MAL-ctDNA体系紫外吸光度无明显影响,表明二者是以沟槽方式结合且不存在静电作用。计算出的热力学参数表明,MAL与ctDNA的结合作用主要由氢键和范德华力驱动。圆二色谱和红外光谱分析表明,MAL更倾向于与ctDNA的T碱基结合,并诱导ctDNA由从正常的B型结构转变为高度松散的B型ctDNA结构。分子模拟直观展示了MAL与ctDNA的结合模式为沟槽结合,且主要结合在ctDNA的T碱基富集区,证实了实验结果。凝胶电泳实验表明,MAL没有引起DNA明显损伤。

英文摘要:

The binding properties and mode associated with calf thymus DNA(ctDNA)upon interaction with maltol(MAL)in vitro were investigated in physiological buffer(pH 7.4)by ultraviolet-visible absorption(UV-vis),fluorescence,circular dichroism(CD)and fourier transform infrared spectroscopy(FTIR)coupled with melting experiments and viscosity measurement.The results showed that the relative viscosity and melting temperature of DNA did not changed significantly,and the UV-vis absorbance had no obvious change with increasing concentration of NaCl,which indicated that the mode between MAL and ctDNA was groove and no electrostatic.The calculated thermodynamics parameters by the temperature experiment of ultraviolet showed that hydrogen bonding and van der Waals force were main force.Results from CD and FT-IR analysis manifested that the specific binding site was T base,and MAL induced B-form of ctDNA varied from normal morphology to loose morphology.Then the molecular docking further verified the results of experiments and intuitively showed the binding pose of MAL with ctDNA.The results of agarose gel electrophoresis indicated that MAL didn't induce DNA damage.

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期刊信息
  • 《南昌大学学报:理科版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:南昌大学
  • 主办单位:南昌大学
  • 主编:谢明勇
  • 地址:南昌市南京东路235号南昌大学期刊社
  • 邮编:330047
  • 邮箱:NCDL@chinajournal.net.cn
  • 电话:0791-88305805
  • 国际标准刊号:ISSN:1006-0464
  • 国内统一刊号:ISSN:36-1193/N
  • 邮发代号:44-19
  • 获奖情况:
  • 2004年国家教育部优秀科技期刊,2006年首届中国高校特色科技期刊,2009年第四届华东地区优秀期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,德国数学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:5092