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稻瘟病菌单加氧酶lpmo M1基因的克隆及生物信息学分析
  • ISSN号:0254-5071
  • 期刊名称:《中国酿造》
  • 时间:0
  • 分类:Q933[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]中国科学院大连化学物理研究所,辽宁大连116023, [2]中国科学院大学,北京100049, [3]大连大学医学院,辽宁大连116622
  • 相关基金:国家自然科学基金(31370811);辽宁省自然科学基金(2015020690);中科院青年创新促进会(2015144)
中文摘要:

多糖裂解单加氧酶(LPMO)是一类新型的可以与水解酶系协同降解纤维素、几丁质和淀粉等难溶多糖的酶.以稻瘟病菌(Magnaporthe grisea 70-15)为研究对象,采用逆转录-聚合酶链反应克隆得到多糖裂解单加氧酶基因lpmo M1,成功构建了真核表达载体pPICZαA-lpmo M1.生物信息学分析表明该基因编码区长819 bp,编码272个氨基酸,预测该基因的理论分子质量为28.85ku,等电点为7.66;结构预测显示存在7个O-糖基化位点和16个磷酸化位点,没有N-糖基化位点.通过生物软件Vector NTI对不同来源的LPMO的同源性进行分析,结果显示稻瘟病菌LMO M1与其他LPMO同源性最高仅为41%;系统进化分析发现稻瘟病菌(Magnaporthe grisea 70-15)的多糖裂解单加氧酶LPMOM1与黄孢原毛平革菌(Phanerochaete chrysosporium)的同类酶Gh61D亲缘关系最近.

英文摘要:

Lytic polysaccharide monooxygenases (LPMO) is a new type of enzymes that acts synergistically with hydrolase system to degrade recalci- trant polysaccharide, such as cellulose, chitin and starch. In order to study the function of LPMO from Magnaporthe gn'sea 70-15, lpmo M1 was cloned by RT-PCR and its eukaryotic expression vector pPICZαA-lpmo M1 was constructed. Bioinformatic analysis showed that the coding region of lpmo M1 was 819 bp, which encoded 272 amino acids, and the theory molecule weight was predicted as 28.85 ku and the soelectric point was 7.66. The structure predicted that it had 70-glycosylation sites and 16 phosphorylation sites, but no N-glycosylation sites. Homologous analysis by Vector NTI software indicated that LPMO M1 had a low homology with other LPMOs of the different organisms. The phylgenetic analysis results showed that LPMO M1 had a most close ohvlogenetic relationshio with the LPMO from Phanerochaete chrvsosporium.

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期刊信息
  • 《中国酿造》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国商业联合会
  • 主办单位:中国调味品协会 北京食品科学研究院
  • 主编:赵燕
  • 地址:北京市西城区禄长街头条4号
  • 邮编:100050
  • 邮箱:zgnzzz@163.com
  • 电话:010-83152308/2738传
  • 国际标准刊号:ISSN:0254-5071
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1818/TS
  • 邮发代号:2-124
  • 获奖情况:
  • 多次被评为全国中文核心期刊,中国科技核心期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国乌利希期刊指南,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:21168