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鸡mir-1644基因“seed”区的T〉C多态分析
  • ISSN号:0578-1752
  • 期刊名称:《中国农业科学》
  • 时间:0
  • 分类:Q756[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]河北科技师范学院,河北昌黎066600, [2]济宁学院,山东济宁273155, [3]山东省农业科学院家禽研究所,济南250023, [4]中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193
  • 相关基金:国家青年科学基金(31001003)、国家科技支撑计划课题(2008BADB2804-8-4)、河北省自然科学基金(C2008001308)、河北省高等学校自然科学研究课题(C2010129)
中文摘要:

【目的】观察“seed”区T〉C多态对鸡mir-1644基因“茎环”结构和靶基因选择的影响,分析其在不同鸡群的遗传分布,为揭示其对mir-1644表达调控的影响及表型效应奠定基础。【方法】利用mfold和miRanda软件进行mir-1644二级结构模拟和靶基因预测,采用引入酶切位点RFLP技术对6个鸡群的179个个体进行基因型检测。【结果J①T→C突变可导致pre—mir-1644空间构型和自由能改变,稳定性降低;②预测到21个mir-1644-T和mir-1644-C基因差异调控的靶基因。③在汶上芦花鸡群体内以C等位基因为优势基因,与其它鸡间的基因型分布存在显著差异(P〈0.01)。【结论】“seed”区T〉C突变可能干扰或破坏mir-1644基因的表达调控,且CC基因型可能与汶上芦花鸡某些表型变异有关。

英文摘要:

[ Objective ] This experiment was conducted to study the effect of T 〉 C polymorphisms located in the seed regions of mir-1644 on its stem-loop secondary structure and target selection, and the differences of distribution of this polymorphisms were also detected in different chicken breeds. [Method] The secondary structures of different alleles of mir-1644 and their target genes were predicted using mfold and miranda software respectively. CRS-RFLP technique was used to detected chicken mir-1644 genotype in 6 populations containing 179 individuals. [Result] The results showed that (1) The T→C mutation results in pre-mir-1644 secondary structure change and the free energy of pre-mir-1644-C is higher than that of pre-mir-1644-T; (2) There were 21 target gene differentially regulated by mir-1644-C and mir-1644-T were predicted; (3) Allele C was the dominant allele in Wenshanluhua chicken population, while allele T was the dominant allele in Jiningbairi, Langya, Wugu and populations. The allele and genotype distribution in Wenshangluhua chicken was significantly different with that in other chicken populations (P〈0.01). [Conclusion] These results indicated that T→C mutation may destroy and alter expression and regulation of mir-1644, and CC genotype may be related to some phenotypic variation of Wenshangluhua Chicken.

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期刊信息
  • 《中国农业科学》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院 中国农学会
  • 主编:万建民
  • 地址:北京中关村南大街12号中国农业科学院图书馆楼4101-4103室
  • 邮编:100081
  • 邮箱:zgnykx@caas.cn
  • 电话:010-82109808 82106279
  • 国际标准刊号:ISSN:0578-1752
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1328/S
  • 邮发代号:2-138
  • 获奖情况:
  • 中国期刊方阵“双高”期刊,第三届中国出版政府奖提名奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:85620