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一个水稻穗特异表达锌指蛋白基因的克隆与结构分析
  • ISSN号:1001-7216
  • 期刊名称:《中国水稻科学》
  • 时间:0
  • 分类:Q943.2[生物学—植物学] S511.032[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室,江苏南京210095
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30470921);江苏省自然科学基金资助项目(BK2005090);长江学者和创新团队发展计划资助项目.
中文摘要:

利用生物信息学和RT—PCR方法从水稻中克隆鉴定了一个新的具有TFⅢA型锌指结构的锌指蛋白基因,其开放阅读框为1092bp,编码363个氨基酸残基。组织表达谱结果表明,该基因只在水稻幼穗组织中表达,在成株期的根、叶、茎以及花药中不表达,将其命名为OsZPT3—1。序列分析表明OsZPT3-1具有3个C2H2型锌指结构,在氨基酸的C端没有典型的转录抑制区域DLN—box,但LXLXL的结构仍然表明OsZPT3-1可能是一个转录抑制因子。对OsZPT3—1启动子区域进行预测,结果发现3个MADS-box转录因子识别位点,推测OsZPT3—1可能在MADS-box转录因子的调节下,通过抑制下游基因的表达在水稻穗部器官的毕长发育过程中发挥重要的调控作用。

英文摘要:

Through bioinformatics and the RT-PCR assay, a novel zinc finger protein gene, belonging to TFⅢ A type, was cloned from rice and designated as OsZPT3-1 , which is specifically expressed in rice panicles, but not detected in eulms, leaves, anthers and roots at the adult stage. OsZPT3-1 is 1104 bp in length and its complete opening read frame(ORF) is 1092 bp encoding a protein of 363 amino acid residues. The OsZPT3-1 contains three C2H2 zinc finger motifs and only the third zinc finger has a conserved QALGGH sequence, belonging to B-type zinc finger. There was a Leu-rieh region with consensus of LXLXL in the C-terminal of OsZPT3-1, which might function as a transcription repressor. Promoter analysis revealed three MADS-box transcription factor recognition sites existing in OsZPT3-1 promoter. Taken together, it can be speculated that OsZPT3-1 may play a key regulatory role in the development of panicle by repressing gene expression under the control of MADS-box transeription factors.

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期刊信息
  • 《中国水稻科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:农业部
  • 主办单位:中国水稻研究所
  • 主编:程式华
  • 地址:杭州市体育场路359号中国水稻研究所内
  • 邮编:310006
  • 邮箱:cjrs@263.net
  • 电话:0571-63370278
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-7216
  • 国内统一刊号:ISSN:33-1146/S
  • 邮发代号:32-94
  • 获奖情况:
  • 首届全国科技期刊评比二等奖,第二届全国优秀科技期刊评比三等奖,农业部浙江省优秀期刊,国家期刊奖百种重点期刊,百种中国杰出学术期刊,中国精品科技期刊,中国国际影响力优秀学术期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:17826