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基于SRAP标记的玉米自交系遗传多样性与群体结构分析
  • ISSN号:1001-7283
  • 期刊名称:《作物杂志》
  • 时间:0
  • 分类:S634.3[农业科学—蔬菜学;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:[1]内蒙古农业大学农学院,内蒙古呼和浩特010010
  • 相关基金:内蒙古自治区高等学校科学技术研究项目(NJ05094),国家自然科学基金(31160288)
中文摘要:

利用筛选出的31对SRAP引物,对33份玉米自交系进行PCR扩增,采用PopGene 1.23、Structure2.3.3等软件完成玉米自交系遗传多样性和群体结构剖析,为自交系合理利用和杂交组配提供理论依据。结果显示,31对SRAP引物共检测出196个等位变异,平均6.32个;多态性比率40.00%-70.59%,平均为53.08%;基因多样性为0.2156-0.8854,平均为0.5495;PIC为0.1809-0.8976,平均为0.5507。结构分析表明,K=4时,△K值最大,即这些自交系可以划分成4个类群,依次为Reid、旅大红骨、塘四平头与PB群,新选自交系也相应地被划分到这四大类群里,没有独立成群。4个类群中,塘四平头群与旅大红骨群的遗传关系最近,与Reid群遗传关系最远。从系谱的亲缘关系分析,大部分已知自交系其SRAP聚类结果与系谱追踪结果有较好的一致性。

英文摘要:

Knowledge about the genetic diversity and population structure of maize inbred lines was important to the improvement and utilization of maize inbred lines. 33 maize inbred lines of China were analyzed by the 31 SRAP markers. The genetic diversity of these inbred lines was performed bythe software PopGene 1.23, and the population structure of these materials was revealed by Structure V2.3.3. Results showed that a total of 196 alleles were amplified using 31 SRAP primer pairs, with an average of 6.32 alleles per primer pair, the polymorphic rate averaged 53.08% , ranging from 40.00% to 70.59%. The genetic diversity averaged 0. 5495, ranging from 0. 2156 to 0. 8854,and the PIC averaged 0. 5507, ranging from 0. 1809 to 0. 8976. Results from the clustering analysis based on a model-based method indicated that the 33 materials could be divided into 4 groups,including Reid ( PA and BSSS), Ltida red cob ( LRC ), Tangsipingtou ( TSP), and PB group ( or PB). TSP group kept the minimum Nei's genetic distance with LRC group, and had the farthest genetic relationship with Reid group. The pedigree of some known inbred lines was analyzed. The result of clustering by SRAP were well consisted with family tree.

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期刊信息
  • 《作物杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国作物学会 中国农业科学院作物科学研究所
  • 主编:杜振华
  • 地址:北京中关村南大街12号中国农科院作物所内
  • 邮编:100081
  • 邮箱:zwzz304@mail.caas.net.cn
  • 电话:010-82108790
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-7283
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1808/S
  • 邮发代号:82-220
  • 获奖情况:
  • 第三届全国优秀农业期刊奖,中国科协科技期刊三等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:13960