位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
A novel method for ionizing radiation-induced RNA damage detection by poly(A)-tailing RT-PCR
  • ISSN号:1000-3282
  • 期刊名称:《生物化学与生物物理进展》
  • 时间:0
  • 分类:Q785[生物学—分子生物学] Q691[生物学—生物物理学]
  • 作者机构:[1]Department of Biochemistry and Molecular Biology, Beijing Institute of Radiation Medicine, Beijing 100850, China, [2]Department of Biochemistry and Molecular Biology, Basic Medical Science College, Harbin Medical University, Harbin 150086, China
  • 相关基金:This work was supported by the National Basic Research Program of China (2007CB914601, 2010CB912801) and Beijing Municipal Natural Science Foundation (5112029).
中文摘要:

电离放射(红外) 直接并且间接地引起严重细胞的损坏并且破坏 RNA 完整。RNA 海滨裂缝是红外引起的损坏的最经常的类型。RNA 损坏涉及退化疾病的发展,包括 Alzheimers 疾病和 Parkinsons 疾病。然而, mRNA 损坏的机制和任何产生 pathophysiological 结果糟糕被理解。这是因为有敏感工具的缺乏监视,部分随机损坏发生在 RNA,在给定的 RNA 的特别 RNA 海滨裂缝损坏。在这个工作,用反向的抄写聚合酶链反应(RT-PCR ) 在以后的一个方法 poly RNA 的 3 结束的(A) 增加在特定的 RNA 决定 RNA 海滨裂缝损坏由 poly,(A) 聚合酶被开发了。在从对待红外的 HeLa 房间的特定的 mRNAs,包括的 ABL1, TP53, GADD45A 和 ATR 的损坏的层次被检验。海滨裂缝在检验的所有 mRNAs 被检测。学习 poly 基于 3 结束提供一个新奇、敏感的方法监视 RNA 的(A) 跟踪 RT-PCR 海滨裂缝损坏。

英文摘要:

Ionizing radiation (IR) causes severe cellular damage both directly and indirectly and disrupts RNA integrity. RNA strand breaks are the most frequent type of damage caused by IR. RNA damage is involved in the development of degenerative diseases, in- cluding Alzheimer's disease and Parkinson's disease. However, the mechanism of mRNA damage and any resulting pathophysi- ological outcomes are poorly understood. This is partly because there is a lack of sensitive tools to monitor damage randomly occurring in RNA, especially RNA strand break damage in a given RNA. In this work, a method using the reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) after poly(A) addition to 3'-end of RNA to determine RNA strand break damage in a specific RNA by poly(A) polymerase has been developed. The levels of damage in specific mRNAs, including ABL1, TP53, GADD45A and ATR from IR-treated HeLa cells were examined. Strand breaks were detected in all mRNAs examined. The study provides a novel and sensitive method based on 3+-end poly(A)-tailing RT-PCR to monitor RNA strand break damage.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《生物化学与生物物理进展》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院生物物理研究所 中国生物物理学会
  • 主编:王大成
  • 地址:北京市朝阳区大屯路15号
  • 邮编:100101
  • 邮箱:prog@sun5.ibp.ac.cn
  • 电话:010-64888459
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-3282
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2161/Q
  • 邮发代号:2-816
  • 获奖情况:
  • 1999年中国期刊奖提名奖,2000年中国科学院优秀期刊特别奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国剑桥科学文摘,美国科学引文索引(扩展库),美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:18821