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利用水稻原生质体快速分析miRNA靶标RNA
  • ISSN号:1000-3061
  • 期刊名称:《生物工程学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q522[生物学—生物化学]
  • 作者机构:[1]中国科学院微生物研究所植物基因组学国家重点实验室,北京100101, [2]中国科学院大学,北京100049, [3]北京城市学院,北京100083
  • 相关基金:国家重点基础研究发展计划(973计划)(No.2011CB100703); 国家自然科学基金(Nos.31370161,31030008)资助
中文摘要:

与转基因方法相比,基因瞬时表达系统在基因表达研究上具有快速便捷的特点。为检验水稻mi RNA与靶标基因之间的调控关系,将MIRNA基因与GFP/靶标序列融合基因(或GFP/靶标突变序列融合基因)构建在同一瞬时表达载体上,并转化水稻原生质体,通过观察含有GFP/靶标序列融合基因和GFP/靶标突变序列融合基因的载体之间的荧光强度差异,以及通过q RT-PCR方法检测靶标和非靶标m RNA水平差异来验证mi RNA对靶标基因的调控。用osa MIR156和osa MIR397及其靶标序列对实验设计方法进行验证,荧光显微观察和q RT-PCR检测证明,osami R156和osami R397能降低相应靶标序列GFP融合基因的转录物水平和GFP荧光水平。此种水稻原生质体瞬时表达方法用于在体内进行大规模mi RNA靶标基因检测。由于其他近缘单子叶植物很可能与水稻有近似的小RNA加工系统,因此对于其他单子叶植物mi RNA功能研究也将有很好的应用前景。

英文摘要:

Compared with the transgenic approach, transient assays provide a convenient alternative to analyze gene expression. To analyze the relationship between mi RNAs and their target genes, a rice protoplast system to detect target gene activity was established. The MIRNA and GFP-fused target sequence(or GFP-fused mutated sequence as a non-target control) were constructed into the same plasmid, and then delivered into rice protoplasts. The GFP expression level decreased significantly when the protoplasts were transfected with the plasmid containing GFP-fused target compared to that of the plasmid with non-target sequence either by fluorescence microscopy or q RT-PCR method. Two micro RNA genes, osa MIR156 and osa MIR397, and their target sequences were used to prove the feasibility of the rice protoplast transient assay system. This method will facilitate large-scale screening of rice mi RNA target in vivo, and may be suitable for functional analysis of mi RNAs of other monocot plants that might share the evolutionarily conserved small RNA processing system with rice.

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期刊信息
  • 《生物工程学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院微生物研究所 中国微生物学会
  • 主编:杨胜利
  • 地址:北京市朝阳区大屯路中国科学院微生物研究所内B401室
  • 邮编:100101
  • 邮箱:cjb@im.ac.cn
  • 电话:010-64807509
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-3061
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1998/Q
  • 邮发代号:82-13
  • 获奖情况:
  • 北京市优秀科技期刊期刊奖,中国科协首届优秀学术期刊奖,2000年中科院优秀科技期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:18441