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绵羊夏柏特线虫线粒体pcox1基因的克隆及序列分析
  • ISSN号:1007-1032
  • 期刊名称:《湖南农业大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:S855.9[农业科学—临床兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]吉林农业大学动物科技学院,吉林长春130118, [2]中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室,甘肃兰州730046, [3]西北农林科技大学动物医学院,陕西杨凌712100, [4]湖南农业大学动物医学院,湖南长沙410128
  • 相关基金:国家公益行业(农业)科研专项(201303037)
中文摘要:

以从陕西省泾阳县山羊大肠中采集的5条绵羊夏柏特线虫为研究对象,用通用引物JB3及JB4.5扩增绵羊夏柏特线虫的线粒体细胞色素c氧化酶第1亚基(cox1)基因部分序列(pcox1),将测序获得的序列用ClustalX 1.81程序进行比对,并用PAUP程序MP法构建系统发育树。结果表明:所获得的5个绵羊夏柏特线虫样品pcox1序列长度均为393bp;种系发育分析表明,绵羊夏柏特线虫5个样品位于同一分支,且绵羊夏柏特线虫的pcox1序列种内相对保守(0.5%~2.0%),种问变异显著(9.4%-18.8%),pcox1序列可作为种问变异研究的可靠遗传标记。

英文摘要:

To analyze the sequence variation in the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 (cox1) gene among Chabertia ovina (C. ovina) isolates from goat in Shaanxi province, China and to study its phylogenetic relationships with other nematodes using the cox1 gene sequences, the partial cox1 (pcox1) was amplified from individual C. ovina samples by PCR. The amplified pcox1 sequences were aligned using the ClustalX 1.81 and MP tree was constructed using the software PAUP 4.0. The lengths of all the pcox1 sequences were 393 bp. Phylogenetic analyses showed that all the C. ovina samples from Shaanxi province were clustered in the same clade. Sequences variations in pcox1 with in C. ovina were limited (0.5%-2.0%), while inter-species differences were significant (9.4%-18.8%). Thus, the pcox1 sequences can be used as a genetic marker for identification and population genetic studies of nematodes.

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期刊信息
  • 《湖南农业大学学报:自然科学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:湖南农业大学
  • 主办单位:湖南农业大学
  • 主编:官春云
  • 地址:长沙市芙蓉区农大路1号
  • 邮编:410128
  • 邮箱:zkb4618035@hunan.edu.cn
  • 电话:0731-84618035
  • 国际标准刊号:ISSN:1007-1032
  • 国内统一刊号:ISSN:43-1257/S
  • 邮发代号:42-157
  • 获奖情况:
  • 2006、2008、2010年连续三届全国高校精品科技期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,德国数学文摘,英国科学文摘数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:17328