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一株高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒变异毒株的基因组特征
  • ISSN号:0366-6964
  • 期刊名称:畜牧兽医学报
  • 时间:0
  • 页码:263-269
  • 分类:S852.659.6[农业科学—基础兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]中国农业大学动物医学院农业部动物流行病学与人兽共患病重点实验室,北京100193
  • 相关基金:国家杰出青年基金项目(30825031);现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-36)
  • 相关项目:动物分子病毒学与免疫学
中文摘要:

为了监测我国近年来流行的高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的变异情况,采用RT-PcR分段扩增,对2009年从山东发病猪场分离到的1株PRRSVSD0901的全基因组进行了序列测定和分析。结果表明,不包括Poly(A)尾,该毒株的基因组全长为15320nt;与高致病性PRRSV毒株间的全基因组核苷酸相似性为98.6%-98.7%;该毒株基因组的Nsp2编码区除存在与高致病性毒株相同的30个氨基酸的不连续缺失外,还存在468位的氨基酸缺失和在585586位间插入1个氨基酸,同时,该毒株的结构蛋白GP2、GP3、GP4和M编码区分别存在1个氨基酸的突变。演化分析表明,该毒株尽管与高致病性毒株属于同一亚群,但形成一个独立的小分支。由此表明,该毒株为高致病性PRRSV的变异毒株,说明我国的高致病性PRRSV在流行过程中已出现变异。笔者的研究结果为监测和分析我国的高致病性PRRSV的变异与演化提供了有价值的基因组信息数据。

英文摘要:

In order to monitor the variation of highly pathogenic porcine reproductive and respira- tory virus (PRRSV) prevailing in recent years, the complete genome of a strain of PRRSV SD0901 isolated from one pig farm with clinical outbreak of PRRS was sequenced and analyzed by RT-PCR amplification. The results showed that the genome size of the virus was 15 230 nucleo- tides, excluding the poly (A) tail. Comparative analysis of the whole genomic sequences revealed that the virus shared 98.6%-98.7% identity with the representative strains of highly pathogenic PRRSV, and exhibited additional one amino acid deletion and insertion at the position 468 and 585-586 respectively, besides 30-amino acid deletion within its Nsp2-coding region. In addition, one amino acid variation was found in GP2, GP3, GP4 and M-coding regions of its genome, re- spectively. Phylogenetic analysis showed that the virus formed an individual branch although it belonged to the same subgroup as highly pathogenic PRRSV strains. These findings indicate that the virus is a variant of highly pathogenic PRRSV, implying that the variation of highly patho- genic PRRSV have occurred during its prevailing. Our study provides valuable genomic data for monitoring and analyzing genetic variation and evolution of highly pathogenic PRRSV.

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期刊信息
  • 《畜牧兽医学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国畜牧兽医学会
  • 主编:文杰
  • 地址:北京海淀区圆明园西路2号中国农科院畜牧所
  • 邮编:100193
  • 邮箱:xmsyxb@263.net
  • 电话:010-62815987 62816996
  • 国际标准刊号:ISSN:0366-6964
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1985/S
  • 邮发代号:82-453
  • 获奖情况:
  • 1992年北京优秀期刊奖,1998年、2000年在全国畜牧兽医优秀期刊评比中获一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),瑞典开放获取期刊指南,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:21857