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西藏藏族人群15个短串联重复序列基因座的遗传多态性
  • ISSN号:0253-9772
  • 期刊名称:《遗传》
  • 时间:0
  • 分类:Q987[生物学—遗传学;生物学—人类学] R394[医药卫生—医学遗传学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]辽宁医学院基础学院,锦州121001, [2]辽宁医学院动物科学院,锦州121001, [3]辽宁医学院人类学研究所,锦州121001, [4]辽宁医学院附属第二医院,锦州121001, [5]西藏自治区拉萨市第二人民医院内科,拉萨851000
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(编号:30270696)和辽宁省教育厅基金项目(编号:202172050,2004C038)资助[Supposed by the National Natural Science Foundation of China(No.30270696)and EducationFoundation of Liaoning Province(No.202172050,2004C038)]
中文摘要:

利用多重PCR五色荧光(6FAM、VIC、NED、PET、LIZ)自动化检测技术检测西藏自治区藏族人群DSS1179、D21S11、D7S820、CSF1PO、D3S1358、TH01、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、VWA、TPOX、D18S51、D5S818及FGA共15个STR基因座遗传多态性,获得15个STR基因座的群体遗传学数据。结果显示:15个STR基因座的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡。15个STR基因座的个体鉴别力(Discrimination power,DP)在0.7555~0.9602之间,杂合度(Heterozygosity,H)在0.5651~0.8530之间,多态性信息含量(Polymorphism information content,PIC)在0.5528~0.8456之间,非父排除率(Probability of paternity exclusion,EPP)在0.3811~0.8549之间,累积个体鉴别力为0.999999999,累积非父排除率为0.999999998。15个短串联重复序列基因座适合作为西藏藏族人群的遗传标记,用于人类学、疾病连锁分析、法医学亲子鉴定和个体识别等领域的研究。

英文摘要:

The polymorphism distributions of 15 STR loci (D8S1179, D21S11, D7S820, CSF1PO, D3S1358, THO1, D13S317, D16S539, D2S1338, D19S433, VWA, TPOX, D18S51, D5S818, and FGA ) were investigated in a Tibetan population by multiplex PCR amplification using five fluorochromes (6FAM, VIC, NED, PET, LIZ). Gene frequency, discrimination power (DP), heterozygosity (H), polymorphism information content (PIC) and probability of paternity exclusion (EPP) were calculated, and all loci were tested for Hardy-Weinberg equilibrium. Results indicate that the gene frequency of these 15 STR loci is in Hardy-Weinberg equilibrium. The DP is at 0.7555-0.9602, H is at 0.5651-0.8530, PIC is at 0.5528-0.8456, and EPP is at 0.3811-0.8549. Cumulative DP of the 15 STR is 0.99999999, and cumulative EPP is 0.999999997. Therefore, these 15 STR loci can be used as genetic markers of Tibetan populations in anthropological studies, linkage analysis of genetic diseases, individual identification and paternity testing in forensic medicine.

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期刊信息
  • 《遗传》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国遗传学会
  • 主编:张永清
  • 地址:北京朝阳区北辰西路1号院中国科学院遗传发育所
  • 邮编:100101
  • 邮箱:yczz@genetics.ac.cn
  • 电话:010-64807669
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-9772
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1913/R
  • 邮发代号:2-810
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,《CAJ-CD》执行优秀奖,2008年12月获“中国精品科技期刊”证书和北京市印...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:23270