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西藏昌都藏族15个短串联重复序列基因座的遗传多样性
  • ISSN号:1003-9406
  • 期刊名称:《中华医学遗传学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R394[医药卫生—医学遗传学;医药卫生—基础医学] R282.71[医药卫生—中药学;医药卫生—中医学]
  • 作者机构:[1]西藏民族学院生命科学基础实验室,高原环境与疾病相关基因研究实验室,咸阳712082, [2]西藏大学医学院, [3]西安交通大学教育部环境与疾病相关基因重点实验室
  • 相关基金:国家自然科学基金(30760097);教育部重点课题(208138);教育部科技平台项目(505015)
中文摘要:

目的分析西藏昌都藏族常染色体上15个短串联重复序列(short tandem repeat,STR)位点(D5S818,FGA,D8S1179,D21S11,D7S820,CSF1PO,D3S1358,TH01,D13S317,D16S539,D2S1338,D19S433,vWA,TPOX,D18S51)基因多态性,并分析它们与亚洲其他人群间的遗传学关系。方法采用PCR—STR及基因扫描技术,用ABI3100遗传分析仪检测15个STR基因多态性,研究昌都藏族101名无关个体15个STR位点的基因频率的分布特点。用ARLEQUIN3.0软件计算等位基因频率和各种多态性参数。结果西藏昌都藏族群体中15个STR位点上观察到135个等位基因,等位基因频率分布在0.0065~0.5455之间;平均杂合度为0.7340,个体识别力除了TPOX(0.7927)和TH01(0.7919)外均大于0.8,累计个体识别力为0.9999998,累计非父排除率为0.99999997。结论西藏昌都藏族15个STR位点均具有高度遗传多态性,是群体遗传学研究和法医学鉴定的可选位点。

英文摘要:

Objective To investigate the genetic polymorphism of 15 autosomal short tandem repeat (STR) loci, i. e. D5S818, FGA, D8Sl179, D21Sll, D7S820, CSF1PO, D3S1358, TH01, D13S317, D16S539, D2S1338, D19S433, vWA, TPOX and D18S51, in Tibetan population of Changdu area, and to analyze the genetic relationship between this population and other Asian populations. Methods The 15 loci were amplified simultaneously using a multiplex PCR typing system. Amplified STR fragments were analyzed with an ABI PRISM 3100 Avant DNA Analyzer. Arlequin software version 3.1 was used to obtain allele frequencies and polymorphism parameters. Results There were 135 STR alleles in the 15 STRs of Changdu Tibetan, with allele frequencies ranging from 0. 0065 to 0. 5455. The average heterozygosity was 0. 7340, the discrimination power was higher than 0. 8 except for TPOX and TH01. The accumulative discrimination power was more than 0. 9999998, and the accumulative non-parental exclusion probability was 0. 99999997. Conclusion The 15 STR loci of Changdu Tibetan possess characteristics of high genetic diversity. They can be employed in minority genetics investigation, and individual and paternity test in forensic medicine.

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期刊信息
  • 《中华医学遗传学杂志》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科协
  • 主办单位:中华医学会
  • 主编:
  • 地址:成都市人民南路3段17号
  • 邮编:610041
  • 邮箱:cjmg@cma.org.cn
  • 电话:028-85501165
  • 国际标准刊号:ISSN:1003-9406
  • 国内统一刊号:ISSN:51-1374/R
  • 邮发代号:62-163
  • 获奖情况:
  • 2000年获四川省优秀期刊一等奖,1997年获中国科协优秀期刊二等奖,2000年获中华医学优秀期刊银奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,荷兰医学文摘,美国生物医学检索系统,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:12609