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欧美人群白癜风易感基因多态性与汉族人白癜风的相关性
  • ISSN号:1001-7089
  • 期刊名称:《中国皮肤性病学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R394[医药卫生—医学遗传学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:安徽医科大学第一附属医院皮肤科,安徽合肥230022
  • 相关基金:国家自然科学基金资助(编号:81072460)
中文摘要:

目的:对中国汉族人群白癜风6q27易感区域进行精细定位研究,以期发现白癜风易感基因。方法:收集2942例白癜风患者和2850名正常对照标本,对6q27易感区域内的24个标签SNP位点进行基因分型。采用Plink 1.07和SPSS19.0软件进行统计分析,同时进行条件回归分析和连锁不平衡分析。结果:(1)SNP位点rs2236313、rs9457258、rs720325、rs968334、rs3093025、rs55802221、rs1012656、rs6930998和rs1331299的等位基因频率在病例组和对照组之间具有显著差异,但是通过条件回归分析结果提示没有新的独立信号存在;(2)连锁不平衡分析结果显示rs2236313、rs9457258、rs720325、rs968334和rs30930255位点间具有中度连锁关系(D'〉0.7,r2〉0.4)。结论:本文证实既往报道的SNP是标签SNP,根据基因型填补以后的注释结果认为白癜风6q27区域的关联基因为RNASET2基因。

英文摘要:

Objective:To perform the fine mapping study for vitiligo susceptibility region 6q27 in order to identify the susceptibility gene in Chinese Han population. Methods: Total 24 tag SNPs were genotyped in2942 patients with vitiligo and 2850 healthy controls. The PLINK 1. 07 and SPSS19. 0 software were used for statistical analysis,linkage disequilibrium and regression analysis. Results:( 1) There were significant differences in the allele frequencies of rs2236313,rs9457258,rs720325,rs968334,rs3093025,rs55802221,rs1012656,rs6930998 and rs1331299 between the cases and controls. The regression analysis revealed that there was no independent signals in these SNPs.( 2) The linkage disequilibrium analysis showed there was moderate linkage among rs2236313,rs9457258,rs720325,rs968334 and rs3093025( D '〉 0. 7,r2〉 0. 4).Conclusion: This study identified the previous report,in which SNP rs2236313 is the tag SNP in the vitiligo patients of Chinese Han and the RNASET2 gene is an associated gene in 6q27 region.

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期刊信息
  • 《中国皮肤性病学杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:西安交通大学
  • 主编:彭振辉
  • 地址:陕西省西安市新城区皇城西路30号
  • 邮编:710004
  • 邮箱:CJDV_XG@126.com
  • 电话:029-87217312 87678312
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-7089
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1197/R
  • 邮发代号:52-17
  • 获奖情况:
  • 中国科技论文统计源期刊,中国生物医学类核心期刊,中国学术期刊综合评价数据库来源期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:25128