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OsAKT2/3基因的生物信息学分析
  • ISSN号:1002-1302
  • 期刊名称:《江苏农业科学》
  • 时间:0
  • 分类:S511.035.3[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]中国科学院南京土壤研究所土壤与农业可持续发展国家重点实验室,江苏南京210008, [2]南京林业大学森林资源与环境学院,江苏南京210037
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31000930);国家转基因重大专项基金项目(2009ZX08009-129B)
中文摘要:

为获得抵抗逆境胁迫的相关基因,利用电子克隆方法从水稻中获得了1个新基因,将其命名为OsKAT2(GenBank登陆号为KJ010541)。生物信息学分析结果表明OsKAT2的cDNA序列开放阅读框长1806 bp,编码蛋白质由601个氨基酸组成;OsKAT2蛋白质包含K+通道的保守结构域,属于Shaker家族第II组。通过实时定量荧光PCR分析发现,OsKAT2主要在地上部表达;在干旱、高盐和外源脱落酸( ABA)胁迫处理下,水稻地上部OsKAT2的表达量均降低。初步推测OsKAT2可能在水稻抵抗逆境胁迫中发挥作用,是一个水稻抗非生物逆境改良的候选基因。

英文摘要:

A new gene, designated OsKAT2 (GenBank accession number KJ010541), was isolated from Orazy sati-va by in silico cloning. Bioinformatics analysis showed that the open reading frame of OsKAT2 was 1 806 bp in length enco-ding 601 amid acid residues. The protein OsKAT2 which contained K+ channel conserved domains belonged to group II of family Shaker. Real-time fluorescence quantitative PCR ( RT-qPCR) revealed OsKAT2 was localized in shoot. The expres-sion levels of OsKAT2 declined under drought, salt and in vitro ABA stress. The results indicated that OsKAT2 might play a role in abiotic-stress-tolerance, and could be a candidate gene for rice abiotic-stress-tolerance improvement.

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期刊信息
  • 《江苏农业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:江苏省农业科学院
  • 主办单位:江苏省农业科学院
  • 主编:常有宏
  • 地址:南京孝陵卫钟灵街50号
  • 邮编:210014
  • 邮箱:jsnykx@vip.163.com
  • 电话:025-84390282
  • 国际标准刊号:ISSN:1002-1302
  • 国内统一刊号:ISSN:32-1214/S
  • 邮发代号:28-10
  • 获奖情况:
  • 第二届国家期刊奖百种重点期刊奖,全国优秀科技期刊奖,江苏省“双十佳”期刊奖,国家期刊奖提名奖,华东地区优秀期刊,优秀农业期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:38904