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非培养手段分析珠江口淇澳岛海岸带沉积物中的古菌多样性
  • ISSN号:0253-4193
  • 期刊名称:海洋学报(中文版)
  • 时间:0
  • 页码:2113-2119
  • 语言:中文
  • 分类:Q913.6[天文地球—古生物学与地层学;生物学—古生物学] P736.221[天文地球—海洋地质;天文地球—海洋科学]
  • 作者机构:[1]国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室,福建厦门361005, [2]中国科学院广州地球化学研究所大洋研究中心,广东广州510640
  • 相关基金:国家“973”前期项目(2006CB708200);国家自然科学重点基金项目(40532011).
  • 相关项目:胡安·德富卡洋脊Endeavour段热液生态环境变化与地球化学制约机理研究
中文摘要:

利用古菌16S rDNA特异引物对珠江口淇澳岛海岸带沉积物中古菌的多样性及垂直分布特征进行研究。结果表明珠江口淇澳岛海岸带沉积物中古菌多样性丰富,大部分为新的不可培养古菌;泉古菌在整个沉积物柱中是优势菌群,约占81%;古菌多样性随沉积物深度增加而增加,区系结构也随深度变化而呈现出明显的不同,在表层沉积物中,88%的序列属于Ⅰ型海洋泉古菌(MGI),而在中层和底层检测到的古菌序列大部分与不可培养的富含甲烷的环境序列有最高的同源性,并且有15%的克隆子序列属于甲烷八叠球菌目(Methanosarcinales)和甲烷微菌目(Methanomicrobiales)。QC—PCR结果表明珠江口淇澳岛海岸带沉积物中古菌含量丰富[(1.93±0.60)×10^6~(6.45±0.25)×10^7 16S rDNA拷贝/g],呈现随深度增加含量增加的趋势。

英文摘要:

The vertical distribution and diversity of archaea in the profile of sediment from Qi'ao Island (Zhujiang River Estuary) were investigated by molecular phylogenetic methods. Sequence analysis showed that the archaeal diversity was high in estuarine sediments and many archaea were some new, uncultured archaea. The Crenarchaota (81%) were predominated along the sediment core. The community structure and diversity of archaea shifted greatly within vertical distance. 88 % archaeal sequences from the surface layer fell into marine nitrification Creanarchaeon; most of archaeal sequences from the middle and bottom layers were closely related to environmental clones from methane-rich environments and 15% archaeal sequences in the middle layer clustered with Methanosarcinales and Methanomicrobiales. In addition, the results of QC-PCR demonstrated that the abundance of archaea was high[(1.93 ± 0. 60) × 10^6~ (6.45 ±0.25) × 10^7 16S rDNA copies/g] and increased when the depth increased.

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期刊信息
  • 《海洋学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国海洋学会
  • 主编:陈大可
  • 地址:北京市海淀区大慧寺路8号
  • 邮编:100081
  • 邮箱:hyxbl@263.net
  • 电话:010-62179976
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-4193
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2055/P
  • 邮发代号:82-284
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:18197