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两种独行菜种子cDNA-SRAP反应体系的建立及优化
  • ISSN号:1001-0009
  • 期刊名称:《北方园艺》
  • 时间:0
  • 分类:S636.903.6[农业科学—蔬菜学;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:新疆大学生命科学与技术学院,新疆乌鲁木齐830046
  • 相关基金:新疆维吾尔自治区重大科技专项科技支疆资助项目(200840102-40); 国家自然科学基金资助项目(31160051/C020407)
中文摘要:

以2种独行菜种子为试材,采用cDNA-SRAP技术,研究了dNTPs、Mg2+、上下游引物、cDNA模板、Taq DNA聚合酶浓度等5个因素对独行菜cDNA-SRAP反应体系扩增结果的影响,以期得到适合2种独行菜种子的cDNA-SRAP反应体系,并且对cDNA-SRAP扩增条件进行了优化。结果表明:优化的最佳cDNA-SRAP反应体系(20μL)为10×PCR buffer,cDNA模板用量100ng,Mg2+浓度1.75mmol·L-1,dNTPs浓度0.275mmol·L-1,引物浓度1.0μmol·L-1,Taq DNA聚合酶用量0.5U;利用优化的cDNA-SRAP反应体系能够扩增获得清晰、数目多的条带,可用于后续深入研究2种独行菜不同处理下差异表达基因。

英文摘要:

A cDNA sequence-related amplified polymorphism(SRAP)reaction system of two species Lepidium L.were established and optimiazed by orthogonal experimental design and single factor analysis of different concentration of dNTPs,Mg2+,primer,Taq DNA polymerase and DNA template was conducted.The results showed that the optimal reaction system for the two species of Lepidium L.was followed as 0.275 mmol·L-1 dNTPs,0.5 U Taq DNA polymerase,1.0μmol·L-1 primer,100 ng template cDNA in total 20μL of reaction solution.Using the optimal system of cDNA-SRAP,clear stable and repeatable bands could be amplified from two species of Lepidiumplants for analyzing gene differential expression.

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期刊信息
  • 《北方园艺》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:黑龙江省农科院
  • 主办单位:黑龙江省园艺学会 黑龙江省农业科学院
  • 主编:毕洪文
  • 地址:哈尔滨市南岗区学府路368号
  • 邮编:150086
  • 邮箱:bfyybjb@163.com
  • 电话:0451-86674276
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-0009
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1247/S
  • 邮发代号:14-150
  • 获奖情况:
  • 1996年获黑龙江省优秀期刊奖(二等),2000年获黑龙江省优秀期刊奖,2002年获全国优秀农业期刊奖,2005年获首届黑龙江省出版精品工程提名奖,2009年获中国北方优秀期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:36972