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猪Myopalladin基因多态性与胴体性状的关联分析
  • ISSN号:0366-6964
  • 期刊名称:《畜牧兽医学报》
  • 时间:0
  • 分类:S828.2[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]华南农业大学动物科学学院,广州510642, [2]中山大学生命科学学院,广州510275
  • 相关基金:国家自然科学基金(30300249);国家重点基础研究发展计划“973”项目(2004CB117506);广东省自然科学基金团队项目(04205804)
中文摘要:

采用RT-PCR扩增与直接测序,对猪肌肉组织的一条表达序列标签(EST)(GenBank登录号为BM445313)进行SNP筛查.检测到2个新的SNPs,通过BLAST在NCBI非冗余数据库中进行同源性比对,发现该EST位于Myopalladin基因的3'UTR区.在猪参考家系SCAU-LL F2群体中对其中的一个SNP进行Csp61RFLP基因分型,并与胴体瘦肉率和皮脂率进行关联分析,结果表明基因型CT与CC的瘦肉率均值分别为46%和45%、皮脂率均值分别为42%和44%,在瘦肉率和皮脂率上的差异均达到了显著水平(P<0.05).由此可见,猪Myopalladin不同基因型对胴体性状有着重要影响,是猪育种应用中的一个潜在遗传标记.

英文摘要:

Single nucleotide polymorphisms (SNPs) were detected by RT PCR amplification and sequencing on the EST (GenBank accession No. BM445313)which was expressed in porcine muscle. Two new SNPs were found and located in the 3'UTR region of Myopalladin gene by homologous comparative analysis in the non-redundant sequence database of NCBI through BLAST search. One of the SNPs was genotyped by RFLP with restriction enzyme Csp6I and used for as sociation analysis with carcass traits in the SCAU-LL F2 pig resource population. The results showed that the average carcass lean meat percentage of CT and CC genotype were 46 % and 45% respectively, and the average carcass skin & fat percentage of the two genotype were 42% and 44% respectively, these differences were significant (P〈0.05). Therefore, it could be seen that porcine Myopalladin genotypes had significant influence on carcass traits, and might be considered as a potential genetic marker for selection.

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期刊信息
  • 《畜牧兽医学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国畜牧兽医学会
  • 主编:文杰
  • 地址:北京海淀区圆明园西路2号中国农科院畜牧所
  • 邮编:100193
  • 邮箱:xmsyxb@263.net
  • 电话:010-62815987 62816996
  • 国际标准刊号:ISSN:0366-6964
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1985/S
  • 邮发代号:82-453
  • 获奖情况:
  • 1992年北京优秀期刊奖,1998年、2000年在全国畜牧兽医优秀期刊评比中获一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),瑞典开放获取期刊指南,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:21857