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外源NO对渗透胁迫下油松种子萌发及幼苗生理特性的作用
  • ISSN号:1001-7461
  • 期刊名称:《西北林学院学报》
  • 时间:0
  • 分类:S512.1[农业科学—作物学]
  • 作者机构:西北农林科技大学生命科学学院旱区作物逆境生物学国家重点实验室,陕西杨凌712100
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(31071349);高等学校博士学科点专项基金(20120204110033)
中文摘要:

利用电子克隆和RT-PCR技术,从干旱胁迫的小麦叶片中分离出4条新的具有高度同源性的WSI18基因,即TaWSI18-1、TaWSI18-2、TaWSI18-3和TaWSI18-4(Gene Bank登陆号分别为:KP226849、KP226850、KP226851和KP226852);其开放阅读框均为678 bp,编码225个氨基酸。生物信息学分析表明,该类蛋白具有亲水性,存在多个磷酸化位点,无信号肽结构域及剪切位点,定位于细胞质中,无跨膜结构域;二级结构分析表明,该蛋白α螺旋和无规则卷曲的比例达到90%以上;同源性比较及聚类分析表明,小麦TaWSI18蛋白同无芒雀麦(Bromus inermis,BAN15016)WSI18蛋白和二穗短柄草(Brachypodium distachyon,XP 003569641)LEA3蛋白具有高度的同源性,相似性分别为94%和70%。小麦TaWSI18基因编码蛋白的氨基酸序列的N端存在与LEA蛋白的N端区域高度保守的序列。表明小麦TaWSI18蛋白的性质与LEA3蛋白的相似,说明了小麦的TaWSI18蛋白可能与LEA3蛋白存在相同或相似的功能,为进一步研究其在小麦水分胁迫下的功能奠定基础。

英文摘要:

WSI18,a water stress- induced genes,plays an important role in plants under water deficit. Silico cloning and RT- PCR were taken to isolate four new highly homologous WSI18 genes: TaWSI18- 1,TaWSI18- 2,TaWSI18- 3 and TaWSI18- 4( Gen Bank accession number: KP226849,KP226850,KP226851 and KP226852)in wheat,ORFs of which are all 678 bp encoding 225 amino acids. Bioinformatic analysis showed that they are highly hydrophilic and have multiple phosphorylation sites. They are located to cytoplasm and have no transmembrane domain signal peptides,as well as no splicing sites. The proportion of α helix and random coil are over 90%by a secondary structure prediction. Homology comparison and phylogenetic analysis showed that TaWSI18 proteins are highly homologous to WSI18 of Bromus inermis and LEA3 Brachypodium distachyon,sharing 94% and 70%similarities respectively. In addition,TaWSI18 proteins have conserved amino acid sequences common to LEA protein in the N-terminal region. They also have a similar character to LEA3 protein by bioinformatic analysis that TaWSI18 proteins may have the same or similar function to LEA3 protein,which lies a foundation for the future study on its function under water-stress.

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期刊信息
  • 《西北林学院学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:西北农林科技大学
  • 主编:刘建军
  • 地址:陕西杨陵邰城路3号
  • 邮编:712100
  • 邮箱:xlxb@vip.163.com
  • 电话:029-87082059
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-7461
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1202/S
  • 邮发代号:52-99
  • 获奖情况:
  • 2009 全国高校科技期刊优秀编辑质量奖,2008 第二届中国高校特色科技期刊,2006 中国农学会 中国期刊协会期刊分会 金犁奖...,2002 中国农学会全国优秀农业期刊一等奖,1999 教育部 全国优秀高校自然科学学报及教育部...,陕西省优秀科技期刊一等奖,陕西高校优秀学报一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:24548