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基于核酸脱碱基位点的铽离子荧光增强型单核苷酸多态性识别研究
  • ISSN号:0567-7351
  • 期刊名称:Acta Chimica Sinica
  • 时间:2011.9.9
  • 页码:2137-2142
  • 分类:Q987[生物学—遗传学;生物学—人类学]
  • 作者机构:[1]浙江师范大学物理化学研究所,金华321004
  • 相关基金:国家自然科学基金(No.21075112); 浙江省科技厅“钱江人才”计划项目(No.2009R10058); 电分析化学国家重点实验室基金(No.SKLEAC2010001); 教育部留学回国人员科研启动基金资助项目
  • 相关项目:DNA脱碱基位点的药物小分子识别:电化学研究及其作用模式分析
中文摘要:

基于核酸脱碱基(AP)位点构建了无机配体稀土铽离子(Tb3+)荧光增强型单核苷酸多态性(SNP)识别方法.在目标链靶标碱基对应的探针链上相应位置引入AP位点,发现Tb3+可以选择性地结合在AP位点,光激发时发生从DNA碱基到结合的Tb3+的能量转移,使Tb3+特征荧光显著增强.这种荧光增强作用与靶标碱基及AP位点侧翼碱基类型密切相关.当靶标碱基和侧翼碱基为G时,荧光最强.该方法可用于区分肿瘤抑制基因p53密码子177位的C/G碱基变异.

英文摘要:

Recognition of single-nucleotide polymorphism(SNP) was proposed in this work on the basis of fluorescence enhancement of an inorganic ligand,terbium ion(Tb3+),upon binding at an abasic(AP) site in DNA.The AP site was deliberately introduced in a probe strand just opposite the base of interest in a target strand.Selective binding of Tb3+ at the AP site was found by observations of its characteristic fluorescence enhancement for AP site-containing DNA by comparison with fully matched DNA without the AP site.The enhancement is very dependent on the target base and the bases flanking the AP site.When the target base is G,the maximum enhancement of Tb3+ fluorescence can be obtained especially for guanines flanking the AP site.This method was successfully applied in detection of P177R mutation of codon 177 in cancer repression gene p53,manifesting its potential applications in SNP detection with signal-on fashion.

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期刊信息
  • 《化学学报》
  • 北大核心期刊(2014版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国化学会 中国科学院上海有机化学研究所
  • 主编:周其林
  • 地址:上海市零陵路345号
  • 邮编:200032
  • 邮箱:hxxb@sioc.ac.cn
  • 电话:021-54925085
  • 国际标准刊号:ISSN:0567-7351
  • 国内统一刊号:ISSN:31-1320/O6
  • 邮发代号:4-209
  • 获奖情况:
  • 首届国家期刊奖,第二届国家期刊奖提名奖,中国期刊方阵“双高期刊”
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国科学引文索引(扩展库),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:28694