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纳升液相色谱-高分辨串联质谱分析尿液多肽组及其翻译后修饰
  • ISSN号:0253-3820
  • 期刊名称:《分析化学》
  • 时间:0
  • 分类:O657.63[理学—分析化学;理学—化学]
  • 作者机构:[1]深圳大学生命与海洋科学学院,深圳市微生物基因工程重点实验室,深圳518060, [2]深圳大学生命与海洋科学学院,深圳市海洋生物资源与生态环境重点实验室,深圳518060
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(No.31470804); 深圳市重点项目(No.JSGG20140703163838793); 深圳市基础科学布局项目阿尔茨海默症临床诊断研究(No.基20150006)资助~~
中文摘要:

多肽组是指生物体表达的所有多肽,尿液等体液的多肽组是生物标记物的重要来源。本研究采用氧化石墨烯-磷酸镧纳米磁性复合材料分离富集尿液多肽,进行纳升液相色谱-高分辨串联质谱分析,从单一样本中鉴定了归属于123个蛋白质的790条肽段。研究表明,这些肽段在蛋白质水平上不是平均分布的。此外,本研究检测到了肽段的氧化、磷酸化和脱氨化等翻译后修饰现象,观察到了尿液多肽的阶梯序列性,从蛋白水平上对尿液多肽组进行了生物信息学分析,结果表明,这些多肽所归属的大部分蛋白质之间存在相互作用。本方法可为在尿液中寻找疾病的标志物提供方法学支持。

英文摘要:

Peptidomics is an emerging field branching from proteomincs that targets endogenous peptides of a whole organism or a subsystem. Many peptides in body fluids including urine are biomarkers with higher clinical sensitivity and specificity. In this study, we separated and enriched these peptides in human urine by the graphene oxide-lanthanum phosphate composite nanomaterial (LaGM), then identified and analyzed by nano liquid chromatography-high resolution tandem mass spectrometry. In single urine sample, 790 peptides which belong to 123 proteins were identified, and some post-translational modifications including oxidation, phosphorylation, deamidated etc, were also identified. There existed a series of peptide ladders in urine peptidomic. At last, the string analysis on protein level revealed strong interaction among the proteins which the identified peptides belonged. This method can provide support for finding the biomarkers of disease in urine.

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期刊信息
  • 《分析化学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国化学会 中国科学院长春应用化学研究所
  • 主编:杨秀荣
  • 地址:长春市人民大街5625号
  • 邮编:130022
  • 邮箱:fxhx@ciac.ac.cn
  • 电话:0431-85262017
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-3820
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1125/O6
  • 邮发代号:12-6
  • 获奖情况:
  • 1999获首届国家期刊奖,2000年获中国科学院优秀期刊特别奖,2001年入选中国期刊方阵“双高”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国工程索引,美国乌利希期刊指南,美国剑桥科学文摘,美国科学引文索引(扩展库),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:52455