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紫丁香蘑ISSR—PCR反应体系的正交优化与建立
  • ISSN号:1004-311X
  • 期刊名称:《生物技术》
  • 时间:0
  • 分类:Q939.5[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]沈阳农业大学生物科学技术学院,辽宁沈阳110866
  • 相关基金:国家青年科学基金项目(“香蘑属系统发育关系的重建与DNA条形码的筛选”,31200011);沈阳农业大学青年基金项目(20111012)资助
中文摘要:

目的:为了获得紫丁香蘑的最佳ISSR—PCR反应体系。方法:采用正交实验方法L16(4-5),对PCR反应的5个重要因素,TaqDNA聚合酶、Mg2+、模板DNA、dNTP以及引物的浓度在4个水平进行优化。结果:得到最佳的反应体系(25μL),包括1.5UTaqDNA聚合酶、2.5mmol/LMg2+、0.2mmol/LdNTP、0.15μmol/L引物、160ng模板DNA,最佳反应循环数为37。通过极差分析,对紫丁香蘑ISSR—PCR反应的影响程度从大到小依次为:TaqDNA聚合酶、dNTP、模板DNA、Mg2+、引物。使用该优化体系从23个ISSR引物中筛选出6个引物使不同地区的紫丁香蘑具有多态性。结论:研究结果为进一步采用ISSR分子标记方法研究紫丁香蘑的遗传多样性提供了研究基础。

英文摘要:

Objective: In order to obtain the optimal ISSR - PCR amplification system of Lepista nuda, an orthogonal design experiment was proceeded in this paper. Method: The 5 factors (Taq DNA enzyme, Mg2 + , template DNA, dNTP, primers) with 4 levels Ll6 (45 ) was con- ducted. Result:The optimal reaction system:25 μL system,Taq DNA enzyme 1.5 U, Mg2+ 2. 5 mmol/L, template DNA 160 ng, dNTP 0. 2 mmol/L,primer 0. 15 μmol/L. The optimal response procedures need 37 cycles for PCR. The results of range analysis showed that the or- der of the five factors influence degree to ISSR, i. e. Taq DNA polymerase, dNTP, template DNA, Mg2 + , primers. Based on the optimized system,we selected 6 primers,which possessed polymorphism for the different sources Lepista nuda, among 23 ISSR primers. Conclusion: The results of this paper provided the research foundation for the further study of genetic diversity of Lepista nuda.

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期刊信息
  • 《生物技术》
  • 北大核心期刊(2014版)
  • 主管单位:黑龙江省科学院
  • 主办单位:黑龙江省科学院微生物研究所 黑龙江省微生物学会 黑龙江省生物工程学会
  • 主编:张介驰
  • 地址:哈尔滨市道里区兆麟街68号
  • 邮编:150010
  • 邮箱:swjszz@163.com
  • 电话:0451-84615121
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-311X
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1319/Q
  • 邮发代号:14-225
  • 获奖情况:
  • 中国生物学核心期刊,中国核心期刊(遴选)数据库...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:13503