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斑马鱼胚胎中受Nodal信号调控基因的鉴定
  • ISSN号:1000-3282
  • 期刊名称:《生物化学与生物物理进展》
  • 时间:0
  • 分类:Q7[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]清华大学生物科学与技术系发育生物学实验室,蛋白质科学教育部重点实验室,北京100084
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项(30570197).
中文摘要:

Nodal信号在脊椎动物胚胎发育的中内胚层诱导、左右不对称性的建立、神经外胚层沿前后轴线的分化等方面起着重要的作用.为鉴定受Nodal信号调控的基因,特别是那些转录因子基因,通过将来自squint过量表达、缺失Nodal信号的MZoep突变体或野生型30%外包期胚胎的RNA与Affymetrix斑马鱼寡核苷酸芯片杂交.发现与野生型样本相比,在squint过量表达的样本中,265个转录本的表达显著增强(log2ratio〉1),111个转录本的表达显著减弱(log2ratio〈-1);在MZoep样本中,表达显著增强的(log2ratio〉1)转录本有1495个,表达显著减弱(log2ratio〈-1)的有550个.squint过量表达使26个转录因子基因的表达增强,11个转录因子基因的表达减弱;另一方面,MZoep突变体中表达增强的转录因子基因为69个,表达减弱的转录因子基因为30个.这些结果为进一步研究Nodal信号的转导机理和生物学功能提供了有益的数据.

英文摘要:

Nodal signals play important roles in mesendoderm induction, establishment of left-right asymmetry and anteroposterior patterning of the neuroectoderm during vertebrate embryogenesis. It is aimed at identifying Nodal-regulated genes in zebrafish embryos, particularly those encoding transcription factors. A (Affymetrix) genechip analysis was performed using RNAs derived from embryos injected with squint mRNA, MZoep mutant embryos that are deficient in Nodal signaling, and wildtype embryos at the 30% epiboly stage. Transcripts (genes) with at least two-fold changes in expression level between wildtype and the other samples were identified. In squint mRNA-injected embryos, 265 transcripts show an increased expression level and 111 have a decreased expression level; in MZoep embryos, the expression of 1 495 transcripts increases while 550 transcripts express at a decreased level. Furthermore, overexpression of squint causes increased expression of 26 and decreased expression of 11 annotated transcription factor genes; in MZoep embryos, the number of trans.cription factor genes showing an increase and decrease of expression are 69 and 30, respectively. These results would provide useful information for further studying mechanisms and biological functions of Nodal signal transduction.

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期刊信息
  • 《生物化学与生物物理进展》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院生物物理研究所 中国生物物理学会
  • 主编:王大成
  • 地址:北京市朝阳区大屯路15号
  • 邮编:100101
  • 邮箱:prog@sun5.ibp.ac.cn
  • 电话:010-64888459
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-3282
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2161/Q
  • 邮发代号:2-816
  • 获奖情况:
  • 1999年中国期刊奖提名奖,2000年中国科学院优秀期刊特别奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国剑桥科学文摘,美国科学引文索引(扩展库),美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:18821