位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
枯草芽孢杆菌BJ3-2精氨酸脱羧酶基因speA的克隆与序列分析
  • ISSN号:0254-5071
  • 期刊名称:《中国酿造》
  • 时间:0
  • 分类:TS201.3[轻工技术与工程—食品科学;轻工技术与工程—食品科学与工程]
  • 作者机构:[1]贵州大学生命科学学院,贵州贵阳550025
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31260394/C200207);贵州大学研究生创新基金项目(校研农2013027)
中文摘要:

根据GenBank中枯草芽孢杆菌168菌株的精氨酸脱羧酶基因speA序列设计特异性引物,提取Bacillus subtilis BJ3-2基因组DNA进行PCR扩增,并克隆至pGEM-T载体后测序.序列分析结果表明,Bacillus subtilis BJ3-2 speA基因ORF长为1 473 bp,可编码490个氨基酸,分子质量为53.53ku,基因登录号为KJ561348,与已报道枯草芽孢杆菌的sepA基因核苷酸序列和氨基酸序列同源性均达93%以上,精氨酸脱羧酶氨基酸序列系统进化树分析,发现Bacillus subtilis BJ3-2的ADC与Bacillus subtilis 168亲缘关系最近,属于典型的Ⅲ型PLP依赖型鸟氨酸/赖氨酸/精氨酸脱羧酶家族成员.speA基因序列分析及其蛋白保守结构域的分析,为有效控制水豆豉产品中生物胺含量的研究提供了理论依据.

英文摘要:

Based on the arginine decarboxylase gene speA of Bacillus subtilis strain168 registered in GenBank, specific primers were designed using software DNAStar. The speA was amplified by PCR from genomic DNA of the B. subtilis B J3-2, and cloned to the pGEM-T vector for sequencing. The results of sequence analysis indicated that the open reading frame length of B. subtilis BJ3-2 speA gene was 1 473 bp, which could encode 490 amino acids with deduced molecular weight of 53.53 ku, and the GenBank accession number was No. KJ561348. The results showed that the speA gene ofB. subtilis B J3-2 was about 93% identical to the other similar nucleotide and amino acid sequences from GenBank. Phylogenetic tree indicat- ed that B. subtilis B J3-2 ADC was the nearest relative to B.subtilis strain 168, which belonged to the type III PLP-dependent ornithine decarboxylase/lysine decarboxylase/arginine decarboxylase family. The gene sequence and conserved structure domain analysis of speA would bring some new clue for further exploration of controlling the biogenic amine content of the fermented soybeans.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《中国酿造》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国商业联合会
  • 主办单位:中国调味品协会 北京食品科学研究院
  • 主编:赵燕
  • 地址:北京市西城区禄长街头条4号
  • 邮编:100050
  • 邮箱:zgnzzz@163.com
  • 电话:010-83152308/2738传
  • 国际标准刊号:ISSN:0254-5071
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1818/TS
  • 邮发代号:2-124
  • 获奖情况:
  • 多次被评为全国中文核心期刊,中国科技核心期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国乌利希期刊指南,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:21168