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基于mtDNA Cytb序列分析养殖与野生刀鲚群体的遗传多样性
  • ISSN号:1000-2286
  • 期刊名称:《江西农业大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:S965.227[农业科学—水产养殖;农业科学—水产科学]
  • 作者机构:[1]南京农业大学无锡渔业学院,江苏无锡214081, [2]中国水产科学研究院淡水渔业研究中心/农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室,江苏无锡214081
  • 相关基金:国家科技支撑计划项目(2012BAD26B05); 中央级公益性科研院所科研专项(2011JBFA17); 公益性行业科研专项(201203065); 江苏省水产三新工程重大项目(DZ2012-1); 江苏省科技支撑计划(农业)项目(BE2011411)
中文摘要:

为比较刀鲚(Coilia nasus)的人工养殖群体与野生群体的遗传结构差异,为刀鲚的种质资源保护和养殖业的可持续发展提供科学依据,应用线粒体DNA细胞色素b基因的序列分析法研究了灌江纳苗养殖刀鲚子三代(F3)、洄游刀鲚(长江野生群体)和湖鲚3个淡水生活环境下的群体遗传多样性。结果显示:刀鲚线粒体DNA细胞色素b基因大小为1 141 bp;在3个群体22尾个体中,找到12种不同的单倍型,单倍型多态性(h)为0.922,多态位点(S)为18,其中单一多态位点9个,简约信息位点9个,核苷酸多样性(π)为0.004 1,平均核苷酸差异数(K)为4.714,平均遗传距离为0.004 2。洄游刀鲚和养殖刀鲚群体的核苷酸多样性、遗传距离都比湖鲚高,说明养殖刀鲚比湖鲚的遗传多样性要丰富,仍保持着较高的遗传多样性。

英文摘要:

To provide a system analysis of differences in genetic diversity,and scientific evidences of conservation of the germ plasm resources and industrialized artifical culture of Coilia nasus,the genetic diversity and genetic structure of Coilia nasus were assessed from three populations by using mitochondrial Cyt b sequences.The complete mitochondrial Cyt b gene sequence is 1141 bp.Twelve haplotypes were detected from the 22 individuals and the haplotype diversity(h) was 0.922.And 18 variation sites were defined,of which 9 were singleton polymorphic sites and the other 9 were parsimony informative polymorphic sites.The nucleotide diversity(π) was 0.004 1,the average nucleotide difference(K) was 4.714 and the average genetic distance was 0.004 2.The result showed that genetic parameters and heredity diversities of farmed Coilia nasus and wild Coilia nasus were higher than those of Coilia nasus taihuensis,which meant farmed Coilia nasus populations still had a high genetic diversity.

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期刊信息
  • 《江西农业大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:江西农业大学
  • 主办单位:江西农业大学
  • 主编:石庆华
  • 地址:江西省南昌市经开区志敏大道1101号江西农业大学期刊社
  • 邮编:330045
  • 邮箱:ndxb7775@sina.com
  • 电话:0791-83813246 83828010
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-2286
  • 国内统一刊号:ISSN:36-1028/S
  • 邮发代号:44-102
  • 获奖情况:
  • 中国期刊方阵双百期刊,国家期刊奖百种重点期刊,中国高校精品科技期刊,华东地区优秀期刊,江西省"名刊建设工程"期刊,江西省优秀期刊一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:20807